Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W3

Txndc11, Thioredoxin domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc11Q8K2W3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Txndc11Q8K2W3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Txndc11Q8K2W3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Txndc11Q8K2W3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Txndc11Q8K2W3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Txndc11Q8K2W3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Txndc11Q8K2W3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Txndc11Q8K2W3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Txndc11Q8K2W3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Txndc11Q8K2W3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Txndc11Q8K2W3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Txndc11Q8K2W3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Txndc11Q8K2W3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Txndc11Q8K2W3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Txndc11Q8K2W3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Txndc11Q8K2W3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Txndc11Q8K2W3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Txndc11Q8K2W3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Txndc11Q8K2W3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Txndc11Q8K2W3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Txndc11Q8K2W3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Txndc11Q8K2W3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Txndc11Q8K2W3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Txndc11Q8K2W3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Txndc11Q8K2W3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Txndc11Q8K2W3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Txndc11Q8K2W3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Txndc11Q8K2W3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Txndc11Q8K2W3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Txndc11Q8K2W3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Txndc11Q8K2W3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Txndc11Q8K2W3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Txndc11Q8K2W3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Txndc11Q8K2W3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Txndc11Q8K2W3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Txndc11Q8K2W3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Txndc11Q8K2W3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Txndc11Q8K2W3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Txndc11Q8K2W3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Txndc11Q8K2W3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Txndc11Q8K2W3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Txndc11Q8K2W3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Txndc11Q8K2W3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Txndc11Q8K2W3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Txndc11Q8K2W3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Txndc11Q8K2W3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Txndc11Q8K2W3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Txndc11Q8K2W3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Txndc11Q8K2W3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Txndc11Q8K2W3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Txndc11Q8K2W3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Txndc11Q8K2W3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Txndc11Q8K2W3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Txndc11Q8K2W3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Txndc11Q8K2W3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Txndc11Q8K2W3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Txndc11Q8K2W3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Txndc11Q8K2W3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Txndc11Q8K2W3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Txndc11Q8K2W3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Txndc11Q8K2W3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Txndc11Q8K2W3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Txndc11Q8K2W3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Txndc11Q8K2W3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Txndc11Q8K2W3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Txndc11Q8K2W3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Txndc11Q8K2W3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Txndc11Q8K2W3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Txndc11Q8K2W3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Txndc11Q8K2W3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Txndc11Q8K2W3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Txndc11Q8K2W3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Txndc11Q8K2W3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Txndc11Q8K2W3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Txndc11Q8K2W3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Txndc11Q8K2W3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Txndc11Q8K2W3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Txndc11Q8K2W3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Txndc11Q8K2W3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Txndc11Q8K2W3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Txndc11Q8K2W3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Txndc11Q8K2W3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Txndc11Q8K2W3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Txndc11Q8K2W3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Txndc11Q8K2W3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Txndc11Q8K2W3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Txndc11Q8K2W3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Txndc11Q8K2W3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Txndc11Q8K2W3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Txndc11Q8K2W3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Txndc11Q8K2W3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Txndc11Q8K2W3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Txndc11Q8K2W3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Txndc11Q8K2W3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Txndc11Q8K2W3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Txndc11Q8K2W3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Txndc11Q8K2W3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Txndc11Q8K2W3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Txndc11Q8K2W3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Txndc11Q8K2W3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms