Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrrdQ8K2M3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrrdQ8K2M3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrrdQ8K2M3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrrdQ8K2M3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrrdQ8K2M3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrrdQ8K2M3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrrdQ8K2M3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SrrdQ8K2M3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SrrdQ8K2M3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SrrdQ8K2M3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrrdQ8K2M3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SrrdQ8K2M3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrrdQ8K2M3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrrdQ8K2M3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrrdQ8K2M3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrrdQ8K2M3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrrdQ8K2M3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrrdQ8K2M3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrrdQ8K2M3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrrdQ8K2M3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrrdQ8K2M3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrrdQ8K2M3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrrdQ8K2M3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrrdQ8K2M3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrrdQ8K2M3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrrdQ8K2M3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrrdQ8K2M3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrrdQ8K2M3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrrdQ8K2M3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrrdQ8K2M3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrrdQ8K2M3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrrdQ8K2M3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrrdQ8K2M3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrrdQ8K2M3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrrdQ8K2M3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrrdQ8K2M3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrrdQ8K2M3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrrdQ8K2M3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrrdQ8K2M3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrrdQ8K2M3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrrdQ8K2M3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrrdQ8K2M3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrrdQ8K2M3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrrdQ8K2M3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrrdQ8K2M3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrrdQ8K2M3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrrdQ8K2M3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrrdQ8K2M3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrrdQ8K2M3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrrdQ8K2M3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrrdQ8K2M3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrrdQ8K2M3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrrdQ8K2M3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrrdQ8K2M3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrrdQ8K2M3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrrdQ8K2M3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrrdQ8K2M3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrrdQ8K2M3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrrdQ8K2M3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrrdQ8K2M3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrrdQ8K2M3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrrdQ8K2M3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrrdQ8K2M3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrrdQ8K2M3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrrdQ8K2M3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrrdQ8K2M3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SrrdQ8K2M3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrrdQ8K2M3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrrdQ8K2M3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrrdQ8K2M3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrrdQ8K2M3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrrdQ8K2M3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrrdQ8K2M3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrrdQ8K2M3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SrrdQ8K2M3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SrrdQ8K2M3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SrrdQ8K2M3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrrdQ8K2M3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrrdQ8K2M3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrrdQ8K2M3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SrrdQ8K2M3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SrrdQ8K2M3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrrdQ8K2M3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrrdQ8K2M3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrrdQ8K2M3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrrdQ8K2M3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrrdQ8K2M3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SrrdQ8K2M3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrrdQ8K2M3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SrrdQ8K2M3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SrrdQ8K2M3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SrrdQ8K2M3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SrrdQ8K2M3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrrdQ8K2M3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SrrdQ8K2M3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrrdQ8K2M3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrrdQ8K2M3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrrdQ8K2M3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrrdQ8K2M3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms