Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D0

Cdk17, Cyclin-dependent kinase 17, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk17Q8K0D0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk17Q8K0D0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk17Q8K0D0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cdk17Q8K0D0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdk17Q8K0D0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk17Q8K0D0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk17Q8K0D0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk17Q8K0D0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk17Q8K0D0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk17Q8K0D0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk17Q8K0D0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk17Q8K0D0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdk17Q8K0D0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk17Q8K0D0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk17Q8K0D0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk17Q8K0D0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk17Q8K0D0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk17Q8K0D0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdk17Q8K0D0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdk17Q8K0D0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdk17Q8K0D0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk17Q8K0D0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk17Q8K0D0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk17Q8K0D0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk17Q8K0D0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk17Q8K0D0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk17Q8K0D0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk17Q8K0D0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk17Q8K0D0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk17Q8K0D0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk17Q8K0D0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk17Q8K0D0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk17Q8K0D0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk17Q8K0D0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk17Q8K0D0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk17Q8K0D0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk17Q8K0D0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk17Q8K0D0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk17Q8K0D0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk17Q8K0D0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk17Q8K0D0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk17Q8K0D0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk17Q8K0D0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk17Q8K0D0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk17Q8K0D0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk17Q8K0D0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk17Q8K0D0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk17Q8K0D0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk17Q8K0D0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk17Q8K0D0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk17Q8K0D0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk17Q8K0D0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk17Q8K0D0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk17Q8K0D0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk17Q8K0D0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk17Q8K0D0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk17Q8K0D0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk17Q8K0D0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk17Q8K0D0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk17Q8K0D0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk17Q8K0D0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk17Q8K0D0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk17Q8K0D0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdk17Q8K0D0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdk17Q8K0D0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk17Q8K0D0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk17Q8K0D0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk17Q8K0D0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk17Q8K0D0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk17Q8K0D0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk17Q8K0D0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk17Q8K0D0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk17Q8K0D0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk17Q8K0D0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk17Q8K0D0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk17Q8K0D0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk17Q8K0D0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk17Q8K0D0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk17Q8K0D0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk17Q8K0D0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk17Q8K0D0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk17Q8K0D0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk17Q8K0D0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk17Q8K0D0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk17Q8K0D0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk17Q8K0D0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk17Q8K0D0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk17Q8K0D0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk17Q8K0D0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk17Q8K0D0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk17Q8K0D0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cdk17Q8K0D0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk17Q8K0D0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk17Q8K0D0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk17Q8K0D0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk17Q8K0D0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk17Q8K0D0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk17Q8K0D0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk17Q8K0D0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk17Q8K0D0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms