Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc17Q8CE13 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc17Q8CE13 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc17Q8CE13 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc17Q8CE13 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc17Q8CE13 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc17Q8CE13 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc17Q8CE13 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc17Q8CE13 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc17Q8CE13 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc17Q8CE13 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc17Q8CE13 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc17Q8CE13 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc17Q8CE13 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc17Q8CE13 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc17Q8CE13 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc17Q8CE13 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc17Q8CE13 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc17Q8CE13 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc17Q8CE13 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc17Q8CE13 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc17Q8CE13 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc17Q8CE13 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc17Q8CE13 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc17Q8CE13 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc17Q8CE13 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc17Q8CE13 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc17Q8CE13 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc17Q8CE13 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc17Q8CE13 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc17Q8CE13 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc17Q8CE13 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc17Q8CE13 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc17Q8CE13 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc17Q8CE13 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc17Q8CE13 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc17Q8CE13 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc17Q8CE13 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc17Q8CE13 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc17Q8CE13 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc17Q8CE13 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc17Q8CE13 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc17Q8CE13 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc17Q8CE13 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc17Q8CE13 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc17Q8CE13 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc17Q8CE13 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc17Q8CE13 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc17Q8CE13 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc17Q8CE13 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc17Q8CE13 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc17Q8CE13 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc17Q8CE13 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc17Q8CE13 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc17Q8CE13 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc17Q8CE13 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc17Q8CE13 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc17Q8CE13 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc17Q8CE13 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc17Q8CE13 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc17Q8CE13 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc17Q8CE13 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc17Q8CE13 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc17Q8CE13 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc17Q8CE13 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc17Q8CE13 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc17Q8CE13 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc17Q8CE13 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc17Q8CE13 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc17Q8CE13 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc17Q8CE13 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc17Q8CE13 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc17Q8CE13 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc17Q8CE13 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc17Q8CE13 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc17Q8CE13 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc17Q8CE13 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc17Q8CE13 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc17Q8CE13 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc17Q8CE13 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc17Q8CE13 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc17Q8CE13 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc17Q8CE13 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc17Q8CE13 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc17Q8CE13 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc17Q8CE13 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc17Q8CE13 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc17Q8CE13 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc17Q8CE13 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc17Q8CE13 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc17Q8CE13 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc17Q8CE13 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc17Q8CE13 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc17Q8CE13 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc17Q8CE13 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc17Q8CE13 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc17Q8CE13 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc17Q8CE13 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc17Q8CE13 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc17Q8CE13 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms