Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atad2Q8CDM1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atad2Q8CDM1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atad2Q8CDM1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atad2Q8CDM1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atad2Q8CDM1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atad2Q8CDM1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atad2Q8CDM1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atad2Q8CDM1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atad2Q8CDM1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atad2Q8CDM1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atad2Q8CDM1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atad2Q8CDM1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atad2Q8CDM1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Atad2Q8CDM1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atad2Q8CDM1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Atad2Q8CDM1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atad2Q8CDM1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Atad2Q8CDM1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atad2Q8CDM1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atad2Q8CDM1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atad2Q8CDM1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atad2Q8CDM1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atad2Q8CDM1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atad2Q8CDM1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atad2Q8CDM1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atad2Q8CDM1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atad2Q8CDM1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atad2Q8CDM1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atad2Q8CDM1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atad2Q8CDM1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atad2Q8CDM1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atad2Q8CDM1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atad2Q8CDM1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atad2Q8CDM1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atad2Q8CDM1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atad2Q8CDM1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atad2Q8CDM1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atad2Q8CDM1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atad2Q8CDM1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atad2Q8CDM1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Atad2Q8CDM1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atad2Q8CDM1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Atad2Q8CDM1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atad2Q8CDM1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atad2Q8CDM1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atad2Q8CDM1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atad2Q8CDM1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atad2Q8CDM1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atad2Q8CDM1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Atad2Q8CDM1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atad2Q8CDM1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atad2Q8CDM1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atad2Q8CDM1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atad2Q8CDM1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atad2Q8CDM1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atad2Q8CDM1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atad2Q8CDM1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atad2Q8CDM1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atad2Q8CDM1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atad2Q8CDM1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atad2Q8CDM1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atad2Q8CDM1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atad2Q8CDM1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atad2Q8CDM1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atad2Q8CDM1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atad2Q8CDM1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atad2Q8CDM1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atad2Q8CDM1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atad2Q8CDM1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atad2Q8CDM1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Atad2Q8CDM1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atad2Q8CDM1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atad2Q8CDM1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atad2Q8CDM1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atad2Q8CDM1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atad2Q8CDM1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atad2Q8CDM1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atad2Q8CDM1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atad2Q8CDM1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atad2Q8CDM1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atad2Q8CDM1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atad2Q8CDM1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atad2Q8CDM1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Atad2Q8CDM1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atad2Q8CDM1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atad2Q8CDM1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atad2Q8CDM1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Atad2Q8CDM1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atad2Q8CDM1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atad2Q8CDM1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atad2Q8CDM1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atad2Q8CDM1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atad2Q8CDM1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atad2Q8CDM1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atad2Q8CDM1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atad2Q8CDM1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atad2Q8CDM1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atad2Q8CDM1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atad2Q8CDM1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms