Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

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Length 1,013 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Phf20l1Q8CCJ9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Phf20l1Q8CCJ9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Phf20l1Q8CCJ9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Phf20l1Q8CCJ9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Phf20l1Q8CCJ9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Phf20l1Q8CCJ9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Phf20l1Q8CCJ9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Phf20l1Q8CCJ9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Phf20l1Q8CCJ9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Phf20l1Q8CCJ9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Phf20l1Q8CCJ9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Phf20l1Q8CCJ9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Phf20l1Q8CCJ9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Phf20l1Q8CCJ9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Phf20l1Q8CCJ9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Phf20l1Q8CCJ9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Phf20l1Q8CCJ9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Phf20l1Q8CCJ9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Phf20l1Q8CCJ9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Phf20l1Q8CCJ9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Phf20l1Q8CCJ9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Phf20l1Q8CCJ9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Phf20l1Q8CCJ9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Phf20l1Q8CCJ9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Phf20l1Q8CCJ9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Phf20l1Q8CCJ9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Phf20l1Q8CCJ9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Phf20l1Q8CCJ9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Phf20l1Q8CCJ9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Phf20l1Q8CCJ9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Phf20l1Q8CCJ9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Phf20l1Q8CCJ9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Phf20l1Q8CCJ9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Phf20l1Q8CCJ9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Phf20l1Q8CCJ9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Phf20l1Q8CCJ9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Phf20l1Q8CCJ9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Phf20l1Q8CCJ9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Phf20l1Q8CCJ9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Phf20l1Q8CCJ9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Phf20l1Q8CCJ9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Phf20l1Q8CCJ9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Phf20l1Q8CCJ9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Phf20l1Q8CCJ9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Phf20l1Q8CCJ9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Phf20l1Q8CCJ9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Phf20l1Q8CCJ9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Phf20l1Q8CCJ9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Phf20l1Q8CCJ9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Phf20l1Q8CCJ9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Phf20l1Q8CCJ9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Phf20l1Q8CCJ9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
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Phf20l1Q8CCJ9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Phf20l1Q8CCJ9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Phf20l1Q8CCJ9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Phf20l1Q8CCJ9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Phf20l1Q8CCJ9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Phf20l1Q8CCJ9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Phf20l1Q8CCJ9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Phf20l1Q8CCJ9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Phf20l1Q8CCJ9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Phf20l1Q8CCJ9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
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Phf20l1Q8CCJ9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Phf20l1Q8CCJ9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Phf20l1Q8CCJ9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Phf20l1Q8CCJ9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Phf20l1Q8CCJ9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Phf20l1Q8CCJ9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Phf20l1Q8CCJ9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Phf20l1Q8CCJ9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Phf20l1Q8CCJ9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Phf20l1Q8CCJ9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Phf20l1Q8CCJ9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Phf20l1Q8CCJ9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Phf20l1Q8CCJ9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Phf20l1Q8CCJ9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Phf20l1Q8CCJ9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Phf20l1Q8CCJ9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Phf20l1Q8CCJ9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Phf20l1Q8CCJ9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Phf20l1Q8CCJ9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Phf20l1Q8CCJ9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Phf20l1Q8CCJ9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Phf20l1Q8CCJ9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Phf20l1Q8CCJ9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Phf20l1Q8CCJ9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Phf20l1Q8CCJ9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Phf20l1Q8CCJ9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Phf20l1Q8CCJ9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Phf20l1Q8CCJ9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Phf20l1Q8CCJ9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Phf20l1Q8CCJ9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Phf20l1Q8CCJ9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Phf20l1Q8CCJ9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Phf20l1Q8CCJ9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms