Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9X6

Epc1, Enhancer of polycomb homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epc1Q8C9X6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Epc1Q8C9X6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Epc1Q8C9X6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Epc1Q8C9X6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Epc1Q8C9X6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Epc1Q8C9X6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Epc1Q8C9X6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Epc1Q8C9X6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Epc1Q8C9X6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Epc1Q8C9X6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Epc1Q8C9X6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Epc1Q8C9X6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Epc1Q8C9X6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Epc1Q8C9X6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Epc1Q8C9X6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Epc1Q8C9X6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Epc1Q8C9X6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Epc1Q8C9X6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Epc1Q8C9X6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Epc1Q8C9X6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Epc1Q8C9X6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Epc1Q8C9X6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Epc1Q8C9X6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Epc1Q8C9X6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Epc1Q8C9X6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Epc1Q8C9X6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Epc1Q8C9X6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Epc1Q8C9X6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Epc1Q8C9X6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Epc1Q8C9X6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Epc1Q8C9X6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Epc1Q8C9X6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Epc1Q8C9X6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Epc1Q8C9X6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Epc1Q8C9X6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Epc1Q8C9X6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Epc1Q8C9X6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Epc1Q8C9X6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Epc1Q8C9X6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Epc1Q8C9X6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Epc1Q8C9X6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Epc1Q8C9X6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Epc1Q8C9X6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Epc1Q8C9X6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Epc1Q8C9X6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Epc1Q8C9X6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Epc1Q8C9X6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Epc1Q8C9X6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Epc1Q8C9X6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Epc1Q8C9X6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Epc1Q8C9X6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Epc1Q8C9X6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Epc1Q8C9X6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Epc1Q8C9X6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Epc1Q8C9X6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Epc1Q8C9X6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Epc1Q8C9X6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Epc1Q8C9X6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Epc1Q8C9X6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Epc1Q8C9X6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Epc1Q8C9X6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Epc1Q8C9X6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Epc1Q8C9X6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Epc1Q8C9X6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Epc1Q8C9X6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Epc1Q8C9X6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Epc1Q8C9X6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Epc1Q8C9X6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Epc1Q8C9X6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Epc1Q8C9X6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Epc1Q8C9X6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Epc1Q8C9X6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Epc1Q8C9X6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Epc1Q8C9X6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Epc1Q8C9X6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Epc1Q8C9X6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Epc1Q8C9X6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Epc1Q8C9X6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Epc1Q8C9X6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Epc1Q8C9X6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Epc1Q8C9X6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Epc1Q8C9X6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Epc1Q8C9X6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Epc1Q8C9X6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Epc1Q8C9X6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Epc1Q8C9X6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Epc1Q8C9X6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Epc1Q8C9X6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Epc1Q8C9X6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Epc1Q8C9X6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Epc1Q8C9X6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Epc1Q8C9X6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Epc1Q8C9X6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Epc1Q8C9X6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Epc1Q8C9X6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Epc1Q8C9X6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Epc1Q8C9X6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Epc1Q8C9X6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Epc1Q8C9X6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Epc1Q8C9X6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms