Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9X1

Sntn, Sentan, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SntnQ8C9X1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SntnQ8C9X1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SntnQ8C9X1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SntnQ8C9X1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SntnQ8C9X1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SntnQ8C9X1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SntnQ8C9X1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SntnQ8C9X1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SntnQ8C9X1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SntnQ8C9X1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SntnQ8C9X1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SntnQ8C9X1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SntnQ8C9X1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SntnQ8C9X1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SntnQ8C9X1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SntnQ8C9X1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SntnQ8C9X1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SntnQ8C9X1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SntnQ8C9X1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SntnQ8C9X1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SntnQ8C9X1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SntnQ8C9X1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SntnQ8C9X1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SntnQ8C9X1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SntnQ8C9X1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SntnQ8C9X1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SntnQ8C9X1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SntnQ8C9X1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SntnQ8C9X1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SntnQ8C9X1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SntnQ8C9X1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SntnQ8C9X1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SntnQ8C9X1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SntnQ8C9X1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SntnQ8C9X1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SntnQ8C9X1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SntnQ8C9X1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SntnQ8C9X1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SntnQ8C9X1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SntnQ8C9X1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SntnQ8C9X1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SntnQ8C9X1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SntnQ8C9X1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SntnQ8C9X1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SntnQ8C9X1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SntnQ8C9X1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SntnQ8C9X1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SntnQ8C9X1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SntnQ8C9X1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SntnQ8C9X1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SntnQ8C9X1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SntnQ8C9X1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SntnQ8C9X1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SntnQ8C9X1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SntnQ8C9X1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SntnQ8C9X1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SntnQ8C9X1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SntnQ8C9X1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SntnQ8C9X1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SntnQ8C9X1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SntnQ8C9X1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SntnQ8C9X1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SntnQ8C9X1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SntnQ8C9X1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SntnQ8C9X1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SntnQ8C9X1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SntnQ8C9X1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SntnQ8C9X1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SntnQ8C9X1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SntnQ8C9X1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SntnQ8C9X1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SntnQ8C9X1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SntnQ8C9X1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SntnQ8C9X1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SntnQ8C9X1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SntnQ8C9X1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SntnQ8C9X1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SntnQ8C9X1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SntnQ8C9X1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SntnQ8C9X1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SntnQ8C9X1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SntnQ8C9X1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SntnQ8C9X1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SntnQ8C9X1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SntnQ8C9X1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SntnQ8C9X1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SntnQ8C9X1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SntnQ8C9X1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SntnQ8C9X1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SntnQ8C9X1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SntnQ8C9X1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SntnQ8C9X1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SntnQ8C9X1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SntnQ8C9X1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SntnQ8C9X1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SntnQ8C9X1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SntnQ8C9X1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SntnQ8C9X1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SntnQ8C9X1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SntnQ8C9X1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms