Protein–RNA interactions for Protein: Q8C494

Prr33, Proline-rich protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr33Q8C494 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prr33Q8C494 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prr33Q8C494 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prr33Q8C494 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prr33Q8C494 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prr33Q8C494 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prr33Q8C494 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Prr33Q8C494 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prr33Q8C494 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prr33Q8C494 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prr33Q8C494 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prr33Q8C494 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prr33Q8C494 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prr33Q8C494 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prr33Q8C494 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prr33Q8C494 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prr33Q8C494 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prr33Q8C494 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prr33Q8C494 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prr33Q8C494 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Prr33Q8C494 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prr33Q8C494 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prr33Q8C494 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prr33Q8C494 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prr33Q8C494 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prr33Q8C494 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prr33Q8C494 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prr33Q8C494 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prr33Q8C494 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prr33Q8C494 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prr33Q8C494 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prr33Q8C494 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prr33Q8C494 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prr33Q8C494 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prr33Q8C494 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prr33Q8C494 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prr33Q8C494 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prr33Q8C494 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Prr33Q8C494 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prr33Q8C494 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prr33Q8C494 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prr33Q8C494 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prr33Q8C494 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prr33Q8C494 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prr33Q8C494 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prr33Q8C494 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prr33Q8C494 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prr33Q8C494 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prr33Q8C494 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prr33Q8C494 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prr33Q8C494 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prr33Q8C494 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prr33Q8C494 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prr33Q8C494 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prr33Q8C494 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prr33Q8C494 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prr33Q8C494 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prr33Q8C494 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prr33Q8C494 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prr33Q8C494 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prr33Q8C494 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prr33Q8C494 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prr33Q8C494 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prr33Q8C494 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prr33Q8C494 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prr33Q8C494 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prr33Q8C494 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prr33Q8C494 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prr33Q8C494 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Prr33Q8C494 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prr33Q8C494 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prr33Q8C494 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prr33Q8C494 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prr33Q8C494 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prr33Q8C494 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prr33Q8C494 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prr33Q8C494 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prr33Q8C494 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prr33Q8C494 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prr33Q8C494 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prr33Q8C494 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prr33Q8C494 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prr33Q8C494 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prr33Q8C494 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prr33Q8C494 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prr33Q8C494 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prr33Q8C494 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prr33Q8C494 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prr33Q8C494 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prr33Q8C494 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prr33Q8C494 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prr33Q8C494 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prr33Q8C494 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prr33Q8C494 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prr33Q8C494 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prr33Q8C494 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prr33Q8C494 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Prr33Q8C494 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prr33Q8C494 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prr33Q8C494 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms