Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRU4

Clec9a, C-type lectin domain family 9 member A, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec9aQ8BRU4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec9aQ8BRU4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec9aQ8BRU4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec9aQ8BRU4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Clec9aQ8BRU4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clec9aQ8BRU4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clec9aQ8BRU4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec9aQ8BRU4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec9aQ8BRU4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec9aQ8BRU4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec9aQ8BRU4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec9aQ8BRU4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec9aQ8BRU4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clec9aQ8BRU4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clec9aQ8BRU4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Clec9aQ8BRU4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clec9aQ8BRU4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clec9aQ8BRU4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clec9aQ8BRU4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clec9aQ8BRU4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clec9aQ8BRU4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Clec9aQ8BRU4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Clec9aQ8BRU4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clec9aQ8BRU4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clec9aQ8BRU4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clec9aQ8BRU4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clec9aQ8BRU4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clec9aQ8BRU4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clec9aQ8BRU4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clec9aQ8BRU4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clec9aQ8BRU4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec9aQ8BRU4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec9aQ8BRU4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec9aQ8BRU4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec9aQ8BRU4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec9aQ8BRU4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec9aQ8BRU4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec9aQ8BRU4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clec9aQ8BRU4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clec9aQ8BRU4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clec9aQ8BRU4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clec9aQ8BRU4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clec9aQ8BRU4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clec9aQ8BRU4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec9aQ8BRU4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec9aQ8BRU4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec9aQ8BRU4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clec9aQ8BRU4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clec9aQ8BRU4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clec9aQ8BRU4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clec9aQ8BRU4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clec9aQ8BRU4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clec9aQ8BRU4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clec9aQ8BRU4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec9aQ8BRU4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec9aQ8BRU4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec9aQ8BRU4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec9aQ8BRU4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec9aQ8BRU4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec9aQ8BRU4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec9aQ8BRU4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clec9aQ8BRU4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clec9aQ8BRU4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clec9aQ8BRU4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clec9aQ8BRU4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec9aQ8BRU4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec9aQ8BRU4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clec9aQ8BRU4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec9aQ8BRU4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec9aQ8BRU4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec9aQ8BRU4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec9aQ8BRU4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec9aQ8BRU4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec9aQ8BRU4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec9aQ8BRU4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec9aQ8BRU4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec9aQ8BRU4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clec9aQ8BRU4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clec9aQ8BRU4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec9aQ8BRU4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clec9aQ8BRU4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clec9aQ8BRU4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Clec9aQ8BRU4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clec9aQ8BRU4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clec9aQ8BRU4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec9aQ8BRU4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec9aQ8BRU4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec9aQ8BRU4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clec9aQ8BRU4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec9aQ8BRU4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec9aQ8BRU4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec9aQ8BRU4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec9aQ8BRU4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec9aQ8BRU4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec9aQ8BRU4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec9aQ8BRU4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec9aQ8BRU4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clec9aQ8BRU4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clec9aQ8BRU4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clec9aQ8BRU4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
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