Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5730596B20RikQ8BQ08 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5730596B20RikQ8BQ08 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5730596B20RikQ8BQ08 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
5730596B20RikQ8BQ08 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
5730596B20RikQ8BQ08 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5730596B20RikQ8BQ08 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
5730596B20RikQ8BQ08 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5730596B20RikQ8BQ08 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5730596B20RikQ8BQ08 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
5730596B20RikQ8BQ08 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
5730596B20RikQ8BQ08 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5730596B20RikQ8BQ08 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5730596B20RikQ8BQ08 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5730596B20RikQ8BQ08 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5730596B20RikQ8BQ08 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
5730596B20RikQ8BQ08 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5730596B20RikQ8BQ08 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5730596B20RikQ8BQ08 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
5730596B20RikQ8BQ08 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5730596B20RikQ8BQ08 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5730596B20RikQ8BQ08 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
5730596B20RikQ8BQ08 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms