Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fbxo38Q8BMI0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fbxo38Q8BMI0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fbxo38Q8BMI0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fbxo38Q8BMI0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fbxo38Q8BMI0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fbxo38Q8BMI0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fbxo38Q8BMI0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fbxo38Q8BMI0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Fbxo38Q8BMI0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fbxo38Q8BMI0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fbxo38Q8BMI0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fbxo38Q8BMI0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fbxo38Q8BMI0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fbxo38Q8BMI0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fbxo38Q8BMI0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fbxo38Q8BMI0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fbxo38Q8BMI0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fbxo38Q8BMI0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fbxo38Q8BMI0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fbxo38Q8BMI0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fbxo38Q8BMI0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fbxo38Q8BMI0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fbxo38Q8BMI0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fbxo38Q8BMI0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fbxo38Q8BMI0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fbxo38Q8BMI0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fbxo38Q8BMI0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fbxo38Q8BMI0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Fbxo38Q8BMI0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fbxo38Q8BMI0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fbxo38Q8BMI0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fbxo38Q8BMI0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fbxo38Q8BMI0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fbxo38Q8BMI0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Fbxo38Q8BMI0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Fbxo38Q8BMI0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fbxo38Q8BMI0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fbxo38Q8BMI0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fbxo38Q8BMI0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fbxo38Q8BMI0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fbxo38Q8BMI0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fbxo38Q8BMI0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fbxo38Q8BMI0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fbxo38Q8BMI0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fbxo38Q8BMI0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fbxo38Q8BMI0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fbxo38Q8BMI0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fbxo38Q8BMI0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fbxo38Q8BMI0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Fbxo38Q8BMI0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fbxo38Q8BMI0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fbxo38Q8BMI0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fbxo38Q8BMI0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fbxo38Q8BMI0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fbxo38Q8BMI0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Fbxo38Q8BMI0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fbxo38Q8BMI0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fbxo38Q8BMI0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fbxo38Q8BMI0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fbxo38Q8BMI0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fbxo38Q8BMI0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fbxo38Q8BMI0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fbxo38Q8BMI0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fbxo38Q8BMI0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fbxo38Q8BMI0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fbxo38Q8BMI0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fbxo38Q8BMI0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fbxo38Q8BMI0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fbxo38Q8BMI0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fbxo38Q8BMI0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Fbxo38Q8BMI0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fbxo38Q8BMI0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fbxo38Q8BMI0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fbxo38Q8BMI0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Fbxo38Q8BMI0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fbxo38Q8BMI0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fbxo38Q8BMI0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fbxo38Q8BMI0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fbxo38Q8BMI0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fbxo38Q8BMI0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Fbxo38Q8BMI0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Fbxo38Q8BMI0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fbxo38Q8BMI0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fbxo38Q8BMI0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fbxo38Q8BMI0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fbxo38Q8BMI0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbxo38Q8BMI0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbxo38Q8BMI0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbxo38Q8BMI0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbxo38Q8BMI0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbxo38Q8BMI0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fbxo38Q8BMI0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fbxo38Q8BMI0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fbxo38Q8BMI0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbxo38Q8BMI0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbxo38Q8BMI0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo38Q8BMI0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo38Q8BMI0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo38Q8BMI0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms