Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ9

Csgalnact1, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact1Q8BJQ9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csgalnact1Q8BJQ9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csgalnact1Q8BJQ9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csgalnact1Q8BJQ9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csgalnact1Q8BJQ9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csgalnact1Q8BJQ9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csgalnact1Q8BJQ9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csgalnact1Q8BJQ9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csgalnact1Q8BJQ9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Csgalnact1Q8BJQ9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Csgalnact1Q8BJQ9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Csgalnact1Q8BJQ9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Csgalnact1Q8BJQ9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csgalnact1Q8BJQ9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csgalnact1Q8BJQ9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csgalnact1Q8BJQ9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csgalnact1Q8BJQ9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csgalnact1Q8BJQ9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csgalnact1Q8BJQ9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csgalnact1Q8BJQ9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Csgalnact1Q8BJQ9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Csgalnact1Q8BJQ9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Csgalnact1Q8BJQ9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Csgalnact1Q8BJQ9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Csgalnact1Q8BJQ9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Csgalnact1Q8BJQ9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Csgalnact1Q8BJQ9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Csgalnact1Q8BJQ9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Csgalnact1Q8BJQ9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Csgalnact1Q8BJQ9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Csgalnact1Q8BJQ9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csgalnact1Q8BJQ9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csgalnact1Q8BJQ9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csgalnact1Q8BJQ9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csgalnact1Q8BJQ9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csgalnact1Q8BJQ9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csgalnact1Q8BJQ9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csgalnact1Q8BJQ9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csgalnact1Q8BJQ9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csgalnact1Q8BJQ9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csgalnact1Q8BJQ9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csgalnact1Q8BJQ9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csgalnact1Q8BJQ9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csgalnact1Q8BJQ9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csgalnact1Q8BJQ9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csgalnact1Q8BJQ9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csgalnact1Q8BJQ9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csgalnact1Q8BJQ9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csgalnact1Q8BJQ9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csgalnact1Q8BJQ9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csgalnact1Q8BJQ9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csgalnact1Q8BJQ9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csgalnact1Q8BJQ9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Csgalnact1Q8BJQ9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csgalnact1Q8BJQ9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csgalnact1Q8BJQ9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csgalnact1Q8BJQ9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csgalnact1Q8BJQ9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csgalnact1Q8BJQ9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csgalnact1Q8BJQ9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csgalnact1Q8BJQ9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csgalnact1Q8BJQ9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csgalnact1Q8BJQ9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csgalnact1Q8BJQ9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csgalnact1Q8BJQ9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Csgalnact1Q8BJQ9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csgalnact1Q8BJQ9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csgalnact1Q8BJQ9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csgalnact1Q8BJQ9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Csgalnact1Q8BJQ9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csgalnact1Q8BJQ9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csgalnact1Q8BJQ9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csgalnact1Q8BJQ9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csgalnact1Q8BJQ9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csgalnact1Q8BJQ9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csgalnact1Q8BJQ9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csgalnact1Q8BJQ9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csgalnact1Q8BJQ9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csgalnact1Q8BJQ9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csgalnact1Q8BJQ9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csgalnact1Q8BJQ9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csgalnact1Q8BJQ9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csgalnact1Q8BJQ9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csgalnact1Q8BJQ9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csgalnact1Q8BJQ9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csgalnact1Q8BJQ9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csgalnact1Q8BJQ9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Csgalnact1Q8BJQ9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Csgalnact1Q8BJQ9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csgalnact1Q8BJQ9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csgalnact1Q8BJQ9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csgalnact1Q8BJQ9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csgalnact1Q8BJQ9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csgalnact1Q8BJQ9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csgalnact1Q8BJQ9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csgalnact1Q8BJQ9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csgalnact1Q8BJQ9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csgalnact1Q8BJQ9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms