Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
U2af1l4Q8BGJ9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
U2af1l4Q8BGJ9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
U2af1l4Q8BGJ9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
U2af1l4Q8BGJ9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
U2af1l4Q8BGJ9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
U2af1l4Q8BGJ9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
U2af1l4Q8BGJ9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
U2af1l4Q8BGJ9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
U2af1l4Q8BGJ9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
U2af1l4Q8BGJ9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
U2af1l4Q8BGJ9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
U2af1l4Q8BGJ9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
U2af1l4Q8BGJ9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
U2af1l4Q8BGJ9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
U2af1l4Q8BGJ9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
U2af1l4Q8BGJ9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
U2af1l4Q8BGJ9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
U2af1l4Q8BGJ9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
U2af1l4Q8BGJ9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
U2af1l4Q8BGJ9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
U2af1l4Q8BGJ9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
U2af1l4Q8BGJ9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
U2af1l4Q8BGJ9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
U2af1l4Q8BGJ9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
U2af1l4Q8BGJ9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
U2af1l4Q8BGJ9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
U2af1l4Q8BGJ9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
U2af1l4Q8BGJ9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
U2af1l4Q8BGJ9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
U2af1l4Q8BGJ9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
U2af1l4Q8BGJ9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
U2af1l4Q8BGJ9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
U2af1l4Q8BGJ9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
U2af1l4Q8BGJ9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
U2af1l4Q8BGJ9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
U2af1l4Q8BGJ9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
U2af1l4Q8BGJ9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
U2af1l4Q8BGJ9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
U2af1l4Q8BGJ9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
U2af1l4Q8BGJ9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
U2af1l4Q8BGJ9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
U2af1l4Q8BGJ9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
U2af1l4Q8BGJ9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
U2af1l4Q8BGJ9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
U2af1l4Q8BGJ9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
U2af1l4Q8BGJ9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
U2af1l4Q8BGJ9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
U2af1l4Q8BGJ9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
U2af1l4Q8BGJ9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
U2af1l4Q8BGJ9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
U2af1l4Q8BGJ9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
U2af1l4Q8BGJ9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
U2af1l4Q8BGJ9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
U2af1l4Q8BGJ9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
U2af1l4Q8BGJ9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
U2af1l4Q8BGJ9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
U2af1l4Q8BGJ9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
U2af1l4Q8BGJ9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
U2af1l4Q8BGJ9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
U2af1l4Q8BGJ9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
U2af1l4Q8BGJ9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
U2af1l4Q8BGJ9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
U2af1l4Q8BGJ9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
U2af1l4Q8BGJ9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2af1l4Q8BGJ9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
U2af1l4Q8BGJ9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
U2af1l4Q8BGJ9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
U2af1l4Q8BGJ9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
U2af1l4Q8BGJ9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
U2af1l4Q8BGJ9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
U2af1l4Q8BGJ9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2af1l4Q8BGJ9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2af1l4Q8BGJ9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2af1l4Q8BGJ9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2af1l4Q8BGJ9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2af1l4Q8BGJ9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2af1l4Q8BGJ9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
U2af1l4Q8BGJ9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
U2af1l4Q8BGJ9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
U2af1l4Q8BGJ9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2af1l4Q8BGJ9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2af1l4Q8BGJ9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2af1l4Q8BGJ9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2af1l4Q8BGJ9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2af1l4Q8BGJ9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
U2af1l4Q8BGJ9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2af1l4Q8BGJ9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
U2af1l4Q8BGJ9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
U2af1l4Q8BGJ9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
U2af1l4Q8BGJ9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
U2af1l4Q8BGJ9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
U2af1l4Q8BGJ9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2af1l4Q8BGJ9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2af1l4Q8BGJ9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
U2af1l4Q8BGJ9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms