Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG07

Pld4, Phospholipase D4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld4Q8BG07 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pld4Q8BG07 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pld4Q8BG07 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pld4Q8BG07 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pld4Q8BG07 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pld4Q8BG07 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pld4Q8BG07 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pld4Q8BG07 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pld4Q8BG07 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pld4Q8BG07 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pld4Q8BG07 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pld4Q8BG07 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pld4Q8BG07 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pld4Q8BG07 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pld4Q8BG07 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pld4Q8BG07 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pld4Q8BG07 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pld4Q8BG07 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pld4Q8BG07 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pld4Q8BG07 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pld4Q8BG07 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pld4Q8BG07 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pld4Q8BG07 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pld4Q8BG07 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pld4Q8BG07 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pld4Q8BG07 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pld4Q8BG07 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pld4Q8BG07 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pld4Q8BG07 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pld4Q8BG07 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pld4Q8BG07 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pld4Q8BG07 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pld4Q8BG07 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pld4Q8BG07 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pld4Q8BG07 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pld4Q8BG07 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pld4Q8BG07 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pld4Q8BG07 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pld4Q8BG07 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pld4Q8BG07 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pld4Q8BG07 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pld4Q8BG07 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pld4Q8BG07 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pld4Q8BG07 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pld4Q8BG07 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pld4Q8BG07 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pld4Q8BG07 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pld4Q8BG07 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pld4Q8BG07 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pld4Q8BG07 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pld4Q8BG07 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pld4Q8BG07 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pld4Q8BG07 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pld4Q8BG07 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pld4Q8BG07 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pld4Q8BG07 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pld4Q8BG07 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pld4Q8BG07 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pld4Q8BG07 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pld4Q8BG07 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pld4Q8BG07 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pld4Q8BG07 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pld4Q8BG07 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pld4Q8BG07 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pld4Q8BG07 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pld4Q8BG07 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pld4Q8BG07 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pld4Q8BG07 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pld4Q8BG07 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pld4Q8BG07 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pld4Q8BG07 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pld4Q8BG07 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pld4Q8BG07 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pld4Q8BG07 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pld4Q8BG07 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pld4Q8BG07 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pld4Q8BG07 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pld4Q8BG07 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pld4Q8BG07 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pld4Q8BG07 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pld4Q8BG07 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pld4Q8BG07 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pld4Q8BG07 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pld4Q8BG07 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pld4Q8BG07 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pld4Q8BG07 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pld4Q8BG07 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pld4Q8BG07 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pld4Q8BG07 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pld4Q8BG07 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pld4Q8BG07 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pld4Q8BG07 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pld4Q8BG07 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pld4Q8BG07 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pld4Q8BG07 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pld4Q8BG07 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pld4Q8BG07 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pld4Q8BG07 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pld4Q8BG07 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pld4Q8BG07 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms