Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y73

UPF0722 protein C11orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80Y73 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q80Y73 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q80Y73 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q80Y73 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q80Y73 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q80Y73 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q80Y73 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q80Y73 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q80Y73 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Q80Y73 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q80Y73 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q80Y73 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q80Y73 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q80Y73 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Q80Y73 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q80Y73 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q80Y73 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q80Y73 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q80Y73 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q80Y73 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q80Y73 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q80Y73 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q80Y73 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q80Y73 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q80Y73 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q80Y73 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q80Y73 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q80Y73 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q80Y73 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q80Y73 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q80Y73 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q80Y73 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q80Y73 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q80Y73 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q80Y73 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q80Y73 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q80Y73 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q80Y73 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q80Y73 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q80Y73 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q80Y73 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q80Y73 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q80Y73 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q80Y73 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q80Y73 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q80Y73 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q80Y73 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q80Y73 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Q80Y73 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Q80Y73 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Q80Y73 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q80Y73 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q80Y73 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q80Y73 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q80Y73 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Q80Y73 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q80Y73 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q80Y73 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q80Y73 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q80Y73 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q80Y73 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Q80Y73 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q80Y73 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q80Y73 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q80Y73 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q80Y73 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q80Y73 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Q80Y73 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q80Y73 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q80Y73 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q80Y73 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q80Y73 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q80Y73 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q80Y73 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q80Y73 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q80Y73 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q80Y73 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q80Y73 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q80Y73 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q80Y73 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q80Y73 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q80Y73 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q80Y73 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q80Y73 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Q80Y73 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q80Y73 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q80Y73 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Q80Y73 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q80Y73 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q80Y73 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q80Y73 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q80Y73 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q80Y73 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q80Y73 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q80Y73 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q80Y73 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q80Y73 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q80Y73 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q80Y73 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q80Y73 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.5 ms