Protein–RNA interactions for Protein: Q80XS7

Fam83e, Protein FAM83E, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83eQ80XS7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam83eQ80XS7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam83eQ80XS7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam83eQ80XS7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam83eQ80XS7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam83eQ80XS7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam83eQ80XS7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam83eQ80XS7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam83eQ80XS7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam83eQ80XS7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam83eQ80XS7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam83eQ80XS7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83eQ80XS7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83eQ80XS7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83eQ80XS7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83eQ80XS7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83eQ80XS7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83eQ80XS7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83eQ80XS7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam83eQ80XS7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam83eQ80XS7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam83eQ80XS7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam83eQ80XS7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam83eQ80XS7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam83eQ80XS7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam83eQ80XS7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam83eQ80XS7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam83eQ80XS7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam83eQ80XS7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam83eQ80XS7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam83eQ80XS7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam83eQ80XS7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam83eQ80XS7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam83eQ80XS7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam83eQ80XS7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam83eQ80XS7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam83eQ80XS7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam83eQ80XS7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam83eQ80XS7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam83eQ80XS7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam83eQ80XS7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam83eQ80XS7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam83eQ80XS7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam83eQ80XS7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam83eQ80XS7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam83eQ80XS7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam83eQ80XS7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam83eQ80XS7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam83eQ80XS7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam83eQ80XS7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam83eQ80XS7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam83eQ80XS7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam83eQ80XS7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam83eQ80XS7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam83eQ80XS7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam83eQ80XS7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam83eQ80XS7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam83eQ80XS7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam83eQ80XS7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam83eQ80XS7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam83eQ80XS7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam83eQ80XS7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam83eQ80XS7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam83eQ80XS7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam83eQ80XS7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam83eQ80XS7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam83eQ80XS7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam83eQ80XS7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam83eQ80XS7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam83eQ80XS7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam83eQ80XS7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam83eQ80XS7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam83eQ80XS7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam83eQ80XS7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam83eQ80XS7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam83eQ80XS7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam83eQ80XS7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam83eQ80XS7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam83eQ80XS7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam83eQ80XS7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam83eQ80XS7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam83eQ80XS7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam83eQ80XS7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam83eQ80XS7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam83eQ80XS7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam83eQ80XS7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam83eQ80XS7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam83eQ80XS7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam83eQ80XS7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam83eQ80XS7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam83eQ80XS7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam83eQ80XS7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam83eQ80XS7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam83eQ80XS7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam83eQ80XS7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam83eQ80XS7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam83eQ80XS7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam83eQ80XS7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam83eQ80XS7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam83eQ80XS7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms