Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cfap100Q80VN0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cfap100Q80VN0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cfap100Q80VN0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cfap100Q80VN0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cfap100Q80VN0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cfap100Q80VN0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cfap100Q80VN0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cfap100Q80VN0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cfap100Q80VN0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cfap100Q80VN0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cfap100Q80VN0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Cfap100Q80VN0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cfap100Q80VN0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cfap100Q80VN0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cfap100Q80VN0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cfap100Q80VN0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cfap100Q80VN0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cfap100Q80VN0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cfap100Q80VN0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cfap100Q80VN0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cfap100Q80VN0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cfap100Q80VN0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cfap100Q80VN0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cfap100Q80VN0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cfap100Q80VN0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cfap100Q80VN0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cfap100Q80VN0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cfap100Q80VN0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cfap100Q80VN0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Cfap100Q80VN0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cfap100Q80VN0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cfap100Q80VN0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cfap100Q80VN0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cfap100Q80VN0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cfap100Q80VN0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cfap100Q80VN0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cfap100Q80VN0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cfap100Q80VN0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cfap100Q80VN0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cfap100Q80VN0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cfap100Q80VN0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cfap100Q80VN0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cfap100Q80VN0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cfap100Q80VN0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cfap100Q80VN0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cfap100Q80VN0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cfap100Q80VN0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cfap100Q80VN0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cfap100Q80VN0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cfap100Q80VN0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cfap100Q80VN0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cfap100Q80VN0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cfap100Q80VN0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cfap100Q80VN0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cfap100Q80VN0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cfap100Q80VN0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cfap100Q80VN0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cfap100Q80VN0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cfap100Q80VN0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cfap100Q80VN0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cfap100Q80VN0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cfap100Q80VN0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cfap100Q80VN0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cfap100Q80VN0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cfap100Q80VN0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cfap100Q80VN0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cfap100Q80VN0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cfap100Q80VN0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cfap100Q80VN0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cfap100Q80VN0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cfap100Q80VN0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cfap100Q80VN0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cfap100Q80VN0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cfap100Q80VN0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cfap100Q80VN0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cfap100Q80VN0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cfap100Q80VN0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cfap100Q80VN0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cfap100Q80VN0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cfap100Q80VN0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cfap100Q80VN0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cfap100Q80VN0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cfap100Q80VN0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cfap100Q80VN0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cfap100Q80VN0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cfap100Q80VN0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cfap100Q80VN0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cfap100Q80VN0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cfap100Q80VN0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cfap100Q80VN0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cfap100Q80VN0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cfap100Q80VN0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfap100Q80VN0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cfap100Q80VN0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cfap100Q80VN0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cfap100Q80VN0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cfap100Q80VN0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cfap100Q80VN0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cfap100Q80VN0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms