Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG2

Plxna4, Plexin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna4Q80UG2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Plxna4Q80UG2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Plxna4Q80UG2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Plxna4Q80UG2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Plxna4Q80UG2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Plxna4Q80UG2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Plxna4Q80UG2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Plxna4Q80UG2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Plxna4Q80UG2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Plxna4Q80UG2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Plxna4Q80UG2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Plxna4Q80UG2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Plxna4Q80UG2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Plxna4Q80UG2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Plxna4Q80UG2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Plxna4Q80UG2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Plxna4Q80UG2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Plxna4Q80UG2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Plxna4Q80UG2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Plxna4Q80UG2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Plxna4Q80UG2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Plxna4Q80UG2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Plxna4Q80UG2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Plxna4Q80UG2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Plxna4Q80UG2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Plxna4Q80UG2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Plxna4Q80UG2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Plxna4Q80UG2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Plxna4Q80UG2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Plxna4Q80UG2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Plxna4Q80UG2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Plxna4Q80UG2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Plxna4Q80UG2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Plxna4Q80UG2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Plxna4Q80UG2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Plxna4Q80UG2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Plxna4Q80UG2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Plxna4Q80UG2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Plxna4Q80UG2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Plxna4Q80UG2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Plxna4Q80UG2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Plxna4Q80UG2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Plxna4Q80UG2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Plxna4Q80UG2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Plxna4Q80UG2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Plxna4Q80UG2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Plxna4Q80UG2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Plxna4Q80UG2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Plxna4Q80UG2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Plxna4Q80UG2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Plxna4Q80UG2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Plxna4Q80UG2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Plxna4Q80UG2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Plxna4Q80UG2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Plxna4Q80UG2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Plxna4Q80UG2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Plxna4Q80UG2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Plxna4Q80UG2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Plxna4Q80UG2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Plxna4Q80UG2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Plxna4Q80UG2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Plxna4Q80UG2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Plxna4Q80UG2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Plxna4Q80UG2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Plxna4Q80UG2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Plxna4Q80UG2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Plxna4Q80UG2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Plxna4Q80UG2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Plxna4Q80UG2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Plxna4Q80UG2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Plxna4Q80UG2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Plxna4Q80UG2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Plxna4Q80UG2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Plxna4Q80UG2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Plxna4Q80UG2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Plxna4Q80UG2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Plxna4Q80UG2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Plxna4Q80UG2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Plxna4Q80UG2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Plxna4Q80UG2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Plxna4Q80UG2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Plxna4Q80UG2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Plxna4Q80UG2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Plxna4Q80UG2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Plxna4Q80UG2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Plxna4Q80UG2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Plxna4Q80UG2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Plxna4Q80UG2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Plxna4Q80UG2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Plxna4Q80UG2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Plxna4Q80UG2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Plxna4Q80UG2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Plxna4Q80UG2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Plxna4Q80UG2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Plxna4Q80UG2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Plxna4Q80UG2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Plxna4Q80UG2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Plxna4Q80UG2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Plxna4Q80UG2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Plxna4Q80UG2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms