Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Otop3Q80UF9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Otop3Q80UF9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Otop3Q80UF9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Otop3Q80UF9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Otop3Q80UF9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Otop3Q80UF9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Otop3Q80UF9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Otop3Q80UF9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Otop3Q80UF9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Otop3Q80UF9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Otop3Q80UF9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Otop3Q80UF9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Otop3Q80UF9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Otop3Q80UF9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Otop3Q80UF9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Otop3Q80UF9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Otop3Q80UF9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Otop3Q80UF9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Otop3Q80UF9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Otop3Q80UF9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Otop3Q80UF9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Otop3Q80UF9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Otop3Q80UF9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Otop3Q80UF9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Otop3Q80UF9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Otop3Q80UF9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Otop3Q80UF9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Otop3Q80UF9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Otop3Q80UF9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Otop3Q80UF9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Otop3Q80UF9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Otop3Q80UF9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Otop3Q80UF9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Otop3Q80UF9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Otop3Q80UF9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Otop3Q80UF9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Otop3Q80UF9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Otop3Q80UF9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Otop3Q80UF9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Otop3Q80UF9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Otop3Q80UF9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Otop3Q80UF9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Otop3Q80UF9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Otop3Q80UF9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Otop3Q80UF9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Otop3Q80UF9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Otop3Q80UF9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Otop3Q80UF9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Otop3Q80UF9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Otop3Q80UF9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Otop3Q80UF9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Otop3Q80UF9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Otop3Q80UF9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Otop3Q80UF9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Otop3Q80UF9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Otop3Q80UF9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Otop3Q80UF9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Otop3Q80UF9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Otop3Q80UF9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Otop3Q80UF9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Otop3Q80UF9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Otop3Q80UF9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Otop3Q80UF9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Otop3Q80UF9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Otop3Q80UF9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Otop3Q80UF9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Otop3Q80UF9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Otop3Q80UF9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Otop3Q80UF9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Otop3Q80UF9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Otop3Q80UF9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Otop3Q80UF9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Otop3Q80UF9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Otop3Q80UF9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Otop3Q80UF9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Otop3Q80UF9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Otop3Q80UF9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Otop3Q80UF9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Otop3Q80UF9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Otop3Q80UF9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Otop3Q80UF9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Otop3Q80UF9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Otop3Q80UF9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Otop3Q80UF9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Otop3Q80UF9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Otop3Q80UF9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Otop3Q80UF9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Otop3Q80UF9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Otop3Q80UF9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Otop3Q80UF9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Otop3Q80UF9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Otop3Q80UF9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Otop3Q80UF9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Otop3Q80UF9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Otop3Q80UF9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Otop3Q80UF9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Otop3Q80UF9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Otop3Q80UF9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Otop3Q80UF9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms