Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rims3Q80U57 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rims3Q80U57 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rims3Q80U57 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rims3Q80U57 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rims3Q80U57 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rims3Q80U57 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rims3Q80U57 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rims3Q80U57 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rims3Q80U57 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rims3Q80U57 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rims3Q80U57 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rims3Q80U57 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rims3Q80U57 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rims3Q80U57 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rims3Q80U57 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rims3Q80U57 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rims3Q80U57 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rims3Q80U57 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rims3Q80U57 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rims3Q80U57 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rims3Q80U57 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rims3Q80U57 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rims3Q80U57 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rims3Q80U57 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rims3Q80U57 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rims3Q80U57 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rims3Q80U57 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rims3Q80U57 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rims3Q80U57 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rims3Q80U57 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rims3Q80U57 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rims3Q80U57 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rims3Q80U57 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rims3Q80U57 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rims3Q80U57 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rims3Q80U57 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rims3Q80U57 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rims3Q80U57 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rims3Q80U57 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rims3Q80U57 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rims3Q80U57 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rims3Q80U57 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rims3Q80U57 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rims3Q80U57 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rims3Q80U57 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rims3Q80U57 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rims3Q80U57 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rims3Q80U57 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rims3Q80U57 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rims3Q80U57 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rims3Q80U57 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rims3Q80U57 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rims3Q80U57 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rims3Q80U57 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rims3Q80U57 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rims3Q80U57 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rims3Q80U57 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rims3Q80U57 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rims3Q80U57 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rims3Q80U57 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rims3Q80U57 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rims3Q80U57 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rims3Q80U57 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rims3Q80U57 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rims3Q80U57 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rims3Q80U57 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rims3Q80U57 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rims3Q80U57 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rims3Q80U57 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rims3Q80U57 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rims3Q80U57 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rims3Q80U57 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rims3Q80U57 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rims3Q80U57 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rims3Q80U57 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rims3Q80U57 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rims3Q80U57 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rims3Q80U57 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rims3Q80U57 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rims3Q80U57 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rims3Q80U57 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rims3Q80U57 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rims3Q80U57 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rims3Q80U57 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rims3Q80U57 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rims3Q80U57 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rims3Q80U57 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rims3Q80U57 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rims3Q80U57 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rims3Q80U57 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rims3Q80U57 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rims3Q80U57 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rims3Q80U57 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rims3Q80U57 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rims3Q80U57 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rims3Q80U57 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rims3Q80U57 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rims3Q80U57 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rims3Q80U57 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms