Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox11Q7M6Y2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox11Q7M6Y2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox11Q7M6Y2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox11Q7M6Y2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox11Q7M6Y2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox11Q7M6Y2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox11Q7M6Y2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox11Q7M6Y2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox11Q7M6Y2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox11Q7M6Y2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox11Q7M6Y2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sox11Q7M6Y2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sox11Q7M6Y2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sox11Q7M6Y2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sox11Q7M6Y2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sox11Q7M6Y2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox11Q7M6Y2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox11Q7M6Y2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox11Q7M6Y2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox11Q7M6Y2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox11Q7M6Y2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox11Q7M6Y2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox11Q7M6Y2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox11Q7M6Y2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox11Q7M6Y2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox11Q7M6Y2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox11Q7M6Y2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox11Q7M6Y2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox11Q7M6Y2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox11Q7M6Y2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox11Q7M6Y2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox11Q7M6Y2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox11Q7M6Y2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox11Q7M6Y2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox11Q7M6Y2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox11Q7M6Y2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox11Q7M6Y2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox11Q7M6Y2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox11Q7M6Y2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox11Q7M6Y2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox11Q7M6Y2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox11Q7M6Y2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox11Q7M6Y2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sox11Q7M6Y2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sox11Q7M6Y2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sox11Q7M6Y2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox11Q7M6Y2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox11Q7M6Y2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox11Q7M6Y2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox11Q7M6Y2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox11Q7M6Y2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox11Q7M6Y2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sox11Q7M6Y2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sox11Q7M6Y2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox11Q7M6Y2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox11Q7M6Y2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox11Q7M6Y2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox11Q7M6Y2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox11Q7M6Y2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox11Q7M6Y2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox11Q7M6Y2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox11Q7M6Y2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox11Q7M6Y2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox11Q7M6Y2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox11Q7M6Y2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox11Q7M6Y2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox11Q7M6Y2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox11Q7M6Y2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox11Q7M6Y2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox11Q7M6Y2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox11Q7M6Y2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sox11Q7M6Y2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox11Q7M6Y2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox11Q7M6Y2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox11Q7M6Y2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox11Q7M6Y2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox11Q7M6Y2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sox11Q7M6Y2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Sox11Q7M6Y2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sox11Q7M6Y2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sox11Q7M6Y2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox11Q7M6Y2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox11Q7M6Y2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox11Q7M6Y2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox11Q7M6Y2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox11Q7M6Y2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sox11Q7M6Y2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox11Q7M6Y2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox11Q7M6Y2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox11Q7M6Y2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox11Q7M6Y2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox11Q7M6Y2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox11Q7M6Y2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox11Q7M6Y2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox11Q7M6Y2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox11Q7M6Y2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox11Q7M6Y2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox11Q7M6Y2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox11Q7M6Y2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms