Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snd1Q78PY7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Snd1Q78PY7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snd1Q78PY7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snd1Q78PY7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snd1Q78PY7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snd1Q78PY7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Snd1Q78PY7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snd1Q78PY7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snd1Q78PY7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snd1Q78PY7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snd1Q78PY7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Snd1Q78PY7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snd1Q78PY7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snd1Q78PY7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snd1Q78PY7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snd1Q78PY7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snd1Q78PY7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snd1Q78PY7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snd1Q78PY7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snd1Q78PY7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snd1Q78PY7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snd1Q78PY7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snd1Q78PY7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snd1Q78PY7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snd1Q78PY7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snd1Q78PY7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snd1Q78PY7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snd1Q78PY7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snd1Q78PY7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snd1Q78PY7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snd1Q78PY7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snd1Q78PY7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snd1Q78PY7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snd1Q78PY7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snd1Q78PY7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snd1Q78PY7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snd1Q78PY7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snd1Q78PY7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snd1Q78PY7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snd1Q78PY7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snd1Q78PY7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snd1Q78PY7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snd1Q78PY7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Snd1Q78PY7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snd1Q78PY7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snd1Q78PY7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Snd1Q78PY7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snd1Q78PY7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snd1Q78PY7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snd1Q78PY7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snd1Q78PY7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snd1Q78PY7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snd1Q78PY7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snd1Q78PY7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snd1Q78PY7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snd1Q78PY7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snd1Q78PY7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snd1Q78PY7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snd1Q78PY7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snd1Q78PY7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snd1Q78PY7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snd1Q78PY7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snd1Q78PY7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snd1Q78PY7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snd1Q78PY7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snd1Q78PY7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snd1Q78PY7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snd1Q78PY7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snd1Q78PY7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snd1Q78PY7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snd1Q78PY7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snd1Q78PY7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snd1Q78PY7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Snd1Q78PY7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Snd1Q78PY7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snd1Q78PY7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snd1Q78PY7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snd1Q78PY7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snd1Q78PY7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snd1Q78PY7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snd1Q78PY7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Snd1Q78PY7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snd1Q78PY7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snd1Q78PY7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snd1Q78PY7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snd1Q78PY7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snd1Q78PY7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snd1Q78PY7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snd1Q78PY7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snd1Q78PY7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snd1Q78PY7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snd1Q78PY7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snd1Q78PY7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snd1Q78PY7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snd1Q78PY7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snd1Q78PY7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snd1Q78PY7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snd1Q78PY7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snd1Q78PY7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms