Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Efr3bQ6ZQ18 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efr3bQ6ZQ18 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efr3bQ6ZQ18 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Efr3bQ6ZQ18 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Efr3bQ6ZQ18 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Efr3bQ6ZQ18 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Efr3bQ6ZQ18 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efr3bQ6ZQ18 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efr3bQ6ZQ18 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efr3bQ6ZQ18 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Efr3bQ6ZQ18 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Efr3bQ6ZQ18 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Efr3bQ6ZQ18 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Efr3bQ6ZQ18 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efr3bQ6ZQ18 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efr3bQ6ZQ18 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efr3bQ6ZQ18 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Efr3bQ6ZQ18 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Efr3bQ6ZQ18 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Efr3bQ6ZQ18 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Efr3bQ6ZQ18 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Efr3bQ6ZQ18 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Efr3bQ6ZQ18 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Efr3bQ6ZQ18 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Efr3bQ6ZQ18 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Efr3bQ6ZQ18 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Efr3bQ6ZQ18 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Efr3bQ6ZQ18 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Efr3bQ6ZQ18 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Efr3bQ6ZQ18 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Efr3bQ6ZQ18 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Efr3bQ6ZQ18 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Efr3bQ6ZQ18 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Efr3bQ6ZQ18 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Efr3bQ6ZQ18 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Efr3bQ6ZQ18 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Efr3bQ6ZQ18 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Efr3bQ6ZQ18 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Efr3bQ6ZQ18 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Efr3bQ6ZQ18 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Efr3bQ6ZQ18 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Efr3bQ6ZQ18 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Efr3bQ6ZQ18 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Efr3bQ6ZQ18 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Efr3bQ6ZQ18 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Efr3bQ6ZQ18 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Efr3bQ6ZQ18 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Efr3bQ6ZQ18 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Efr3bQ6ZQ18 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Efr3bQ6ZQ18 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Efr3bQ6ZQ18 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Efr3bQ6ZQ18 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Efr3bQ6ZQ18 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Efr3bQ6ZQ18 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Efr3bQ6ZQ18 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Efr3bQ6ZQ18 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efr3bQ6ZQ18 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efr3bQ6ZQ18 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efr3bQ6ZQ18 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efr3bQ6ZQ18 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efr3bQ6ZQ18 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efr3bQ6ZQ18 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efr3bQ6ZQ18 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efr3bQ6ZQ18 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Efr3bQ6ZQ18 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efr3bQ6ZQ18 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efr3bQ6ZQ18 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Efr3bQ6ZQ18 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Efr3bQ6ZQ18 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Efr3bQ6ZQ18 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Efr3bQ6ZQ18 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Efr3bQ6ZQ18 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Efr3bQ6ZQ18 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Efr3bQ6ZQ18 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Efr3bQ6ZQ18 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Efr3bQ6ZQ18 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Efr3bQ6ZQ18 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Efr3bQ6ZQ18 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efr3bQ6ZQ18 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efr3bQ6ZQ18 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efr3bQ6ZQ18 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Efr3bQ6ZQ18 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Efr3bQ6ZQ18 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Efr3bQ6ZQ18 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Efr3bQ6ZQ18 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Efr3bQ6ZQ18 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Efr3bQ6ZQ18 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Efr3bQ6ZQ18 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Efr3bQ6ZQ18 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Efr3bQ6ZQ18 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Efr3bQ6ZQ18 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Efr3bQ6ZQ18 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Efr3bQ6ZQ18 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Efr3bQ6ZQ18 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Efr3bQ6ZQ18 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Efr3bQ6ZQ18 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Efr3bQ6ZQ18 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Efr3bQ6ZQ18 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Efr3bQ6ZQ18 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms