Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

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Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
NinlQ6ZQ12 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NinlQ6ZQ12 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NinlQ6ZQ12 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NinlQ6ZQ12 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NinlQ6ZQ12 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NinlQ6ZQ12 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NinlQ6ZQ12 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NinlQ6ZQ12 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NinlQ6ZQ12 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NinlQ6ZQ12 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NinlQ6ZQ12 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NinlQ6ZQ12 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
NinlQ6ZQ12 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
NinlQ6ZQ12 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NinlQ6ZQ12 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NinlQ6ZQ12 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NinlQ6ZQ12 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NinlQ6ZQ12 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NinlQ6ZQ12 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NinlQ6ZQ12 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NinlQ6ZQ12 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NinlQ6ZQ12 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NinlQ6ZQ12 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NinlQ6ZQ12 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NinlQ6ZQ12 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NinlQ6ZQ12 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NinlQ6ZQ12 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NinlQ6ZQ12 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NinlQ6ZQ12 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NinlQ6ZQ12 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NinlQ6ZQ12 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NinlQ6ZQ12 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
NinlQ6ZQ12 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NinlQ6ZQ12 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NinlQ6ZQ12 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NinlQ6ZQ12 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NinlQ6ZQ12 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NinlQ6ZQ12 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NinlQ6ZQ12 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NinlQ6ZQ12 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NinlQ6ZQ12 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NinlQ6ZQ12 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NinlQ6ZQ12 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NinlQ6ZQ12 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NinlQ6ZQ12 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NinlQ6ZQ12 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NinlQ6ZQ12 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NinlQ6ZQ12 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NinlQ6ZQ12 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NinlQ6ZQ12 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
NinlQ6ZQ12 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NinlQ6ZQ12 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NinlQ6ZQ12 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NinlQ6ZQ12 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NinlQ6ZQ12 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NinlQ6ZQ12 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NinlQ6ZQ12 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NinlQ6ZQ12 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NinlQ6ZQ12 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NinlQ6ZQ12 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NinlQ6ZQ12 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NinlQ6ZQ12 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NinlQ6ZQ12 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NinlQ6ZQ12 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NinlQ6ZQ12 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NinlQ6ZQ12 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NinlQ6ZQ12 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NinlQ6ZQ12 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
NinlQ6ZQ12 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NinlQ6ZQ12 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NinlQ6ZQ12 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NinlQ6ZQ12 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NinlQ6ZQ12 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
NinlQ6ZQ12 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NinlQ6ZQ12 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NinlQ6ZQ12 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NinlQ6ZQ12 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NinlQ6ZQ12 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NinlQ6ZQ12 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NinlQ6ZQ12 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NinlQ6ZQ12 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NinlQ6ZQ12 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NinlQ6ZQ12 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NinlQ6ZQ12 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NinlQ6ZQ12 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NinlQ6ZQ12 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NinlQ6ZQ12 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NinlQ6ZQ12 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NinlQ6ZQ12 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NinlQ6ZQ12 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NinlQ6ZQ12 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
NinlQ6ZQ12 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NinlQ6ZQ12 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NinlQ6ZQ12 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NinlQ6ZQ12 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NinlQ6ZQ12 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NinlQ6ZQ12 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NinlQ6ZQ12 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NinlQ6ZQ12 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
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