Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33,91■■■■□ 3,02
NinlQ6ZQ12 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC33,91■■■■□ 3,02
NinlQ6ZQ12 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
NinlQ6ZQ12 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
NinlQ6ZQ12 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
NinlQ6ZQ12 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33,85■■■■□ 3,01
NinlQ6ZQ12 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
NinlQ6ZQ12 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33,85■■■■□ 3,01
NinlQ6ZQ12 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
NinlQ6ZQ12 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
NinlQ6ZQ12 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
NinlQ6ZQ12 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,83■■■■□ 3,01
NinlQ6ZQ12 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33,82■■■■□ 3
NinlQ6ZQ12 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,8■■■■□ 3
NinlQ6ZQ12 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
NinlQ6ZQ12 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
NinlQ6ZQ12 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
NinlQ6ZQ12 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
NinlQ6ZQ12 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
NinlQ6ZQ12 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
NinlQ6ZQ12 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33,78■■■■□ 3
NinlQ6ZQ12 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
NinlQ6ZQ12 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
NinlQ6ZQ12 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■■□ 3
NinlQ6ZQ12 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
NinlQ6ZQ12 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
NinlQ6ZQ12 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
NinlQ6ZQ12 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
NinlQ6ZQ12 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
NinlQ6ZQ12 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33,72■■■□□ 2,99
NinlQ6ZQ12 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
NinlQ6ZQ12 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
NinlQ6ZQ12 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33,7■■■□□ 2,98
NinlQ6ZQ12 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
NinlQ6ZQ12 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
NinlQ6ZQ12 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
NinlQ6ZQ12 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
NinlQ6ZQ12 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
NinlQ6ZQ12 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
NinlQ6ZQ12 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,65■■■□□ 2,98
NinlQ6ZQ12 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33,64■■■□□ 2,98
NinlQ6ZQ12 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
NinlQ6ZQ12 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33,64■■■□□ 2,98
NinlQ6ZQ12 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
NinlQ6ZQ12 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
NinlQ6ZQ12 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
NinlQ6ZQ12 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
NinlQ6ZQ12 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC33,6■■■□□ 2,97
NinlQ6ZQ12 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33,59■■■□□ 2,97
NinlQ6ZQ12 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
NinlQ6ZQ12 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC33,58■■■□□ 2,97
NinlQ6ZQ12 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33,58■■■□□ 2,97
NinlQ6ZQ12 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
NinlQ6ZQ12 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
NinlQ6ZQ12 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
NinlQ6ZQ12 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
NinlQ6ZQ12 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
NinlQ6ZQ12 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC33,55■■■□□ 2,96
NinlQ6ZQ12 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
NinlQ6ZQ12 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33,53■■■□□ 2,96
NinlQ6ZQ12 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC33,5■■■□□ 2,95
NinlQ6ZQ12 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC33,49■■■□□ 2,95
NinlQ6ZQ12 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
NinlQ6ZQ12 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
NinlQ6ZQ12 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
NinlQ6ZQ12 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
NinlQ6ZQ12 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
NinlQ6ZQ12 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,47■■■□□ 2,95
NinlQ6ZQ12 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33,46■■■□□ 2,95
NinlQ6ZQ12 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
NinlQ6ZQ12 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
NinlQ6ZQ12 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33,43■■■□□ 2,94
NinlQ6ZQ12 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
NinlQ6ZQ12 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33,42■■■□□ 2,94
NinlQ6ZQ12 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
NinlQ6ZQ12 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC33,4■■■□□ 2,94
NinlQ6ZQ12 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
NinlQ6ZQ12 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
NinlQ6ZQ12 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
NinlQ6ZQ12 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
NinlQ6ZQ12 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
NinlQ6ZQ12 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33,36■■■□□ 2,93
NinlQ6ZQ12 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
NinlQ6ZQ12 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
NinlQ6ZQ12 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
NinlQ6ZQ12 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33,35■■■□□ 2,93
NinlQ6ZQ12 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
NinlQ6ZQ12 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
NinlQ6ZQ12 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC33,34■■■□□ 2,93
NinlQ6ZQ12 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33,34■■■□□ 2,93
NinlQ6ZQ12 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
NinlQ6ZQ12 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33,33■■■□□ 2,93
NinlQ6ZQ12 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33,33■■■□□ 2,93
NinlQ6ZQ12 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33,33■■■□□ 2,93
NinlQ6ZQ12 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
NinlQ6ZQ12 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33,3■■■□□ 2,92
NinlQ6ZQ12 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
NinlQ6ZQ12 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
NinlQ6ZQ12 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
NinlQ6ZQ12 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39,7 ms