Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ift172Q6VH22 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ift172Q6VH22 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ift172Q6VH22 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ift172Q6VH22 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ift172Q6VH22 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ift172Q6VH22 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ift172Q6VH22 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Ift172Q6VH22 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ift172Q6VH22 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ift172Q6VH22 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ift172Q6VH22 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ift172Q6VH22 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ift172Q6VH22 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ift172Q6VH22 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ift172Q6VH22 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ift172Q6VH22 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Ift172Q6VH22 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ift172Q6VH22 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Ift172Q6VH22 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ift172Q6VH22 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ift172Q6VH22 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ift172Q6VH22 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ift172Q6VH22 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ift172Q6VH22 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ift172Q6VH22 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ift172Q6VH22 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ift172Q6VH22 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ift172Q6VH22 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Ift172Q6VH22 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ift172Q6VH22 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Ift172Q6VH22 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ift172Q6VH22 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ift172Q6VH22 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ift172Q6VH22 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ift172Q6VH22 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ift172Q6VH22 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ift172Q6VH22 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ift172Q6VH22 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Ift172Q6VH22 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Ift172Q6VH22 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ift172Q6VH22 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ift172Q6VH22 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ift172Q6VH22 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ift172Q6VH22 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ift172Q6VH22 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ift172Q6VH22 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ift172Q6VH22 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ift172Q6VH22 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ift172Q6VH22 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Ift172Q6VH22 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ift172Q6VH22 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ift172Q6VH22 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ift172Q6VH22 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ift172Q6VH22 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ift172Q6VH22 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ift172Q6VH22 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ift172Q6VH22 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ift172Q6VH22 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ift172Q6VH22 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ift172Q6VH22 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ift172Q6VH22 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ift172Q6VH22 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ift172Q6VH22 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ift172Q6VH22 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ift172Q6VH22 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ift172Q6VH22 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ift172Q6VH22 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ift172Q6VH22 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ift172Q6VH22 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ift172Q6VH22 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ift172Q6VH22 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ift172Q6VH22 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ift172Q6VH22 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ift172Q6VH22 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ift172Q6VH22 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Ift172Q6VH22 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ift172Q6VH22 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ift172Q6VH22 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ift172Q6VH22 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ift172Q6VH22 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ift172Q6VH22 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ift172Q6VH22 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ift172Q6VH22 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ift172Q6VH22 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ift172Q6VH22 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ift172Q6VH22 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Ift172Q6VH22 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ift172Q6VH22 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ift172Q6VH22 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ift172Q6VH22 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ift172Q6VH22 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ift172Q6VH22 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ift172Q6VH22 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ift172Q6VH22 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ift172Q6VH22 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Ift172Q6VH22 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ift172Q6VH22 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ift172Q6VH22 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ift172Q6VH22 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms