Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Med16Q6PGF3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Med16Q6PGF3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Med16Q6PGF3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Med16Q6PGF3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Med16Q6PGF3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Med16Q6PGF3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Med16Q6PGF3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Med16Q6PGF3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Med16Q6PGF3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Med16Q6PGF3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Med16Q6PGF3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Med16Q6PGF3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Med16Q6PGF3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Med16Q6PGF3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Med16Q6PGF3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Med16Q6PGF3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Med16Q6PGF3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Med16Q6PGF3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Med16Q6PGF3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Med16Q6PGF3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Med16Q6PGF3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Med16Q6PGF3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Med16Q6PGF3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Med16Q6PGF3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Med16Q6PGF3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Med16Q6PGF3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Med16Q6PGF3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Med16Q6PGF3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Med16Q6PGF3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Med16Q6PGF3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Med16Q6PGF3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Med16Q6PGF3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Med16Q6PGF3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Med16Q6PGF3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Med16Q6PGF3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Med16Q6PGF3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Med16Q6PGF3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Med16Q6PGF3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Med16Q6PGF3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Med16Q6PGF3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Med16Q6PGF3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Med16Q6PGF3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Med16Q6PGF3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Med16Q6PGF3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Med16Q6PGF3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Med16Q6PGF3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Med16Q6PGF3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Med16Q6PGF3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Med16Q6PGF3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Med16Q6PGF3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Med16Q6PGF3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Med16Q6PGF3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Med16Q6PGF3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Med16Q6PGF3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Med16Q6PGF3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Med16Q6PGF3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Med16Q6PGF3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Med16Q6PGF3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Med16Q6PGF3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Med16Q6PGF3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Med16Q6PGF3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Med16Q6PGF3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Med16Q6PGF3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Med16Q6PGF3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Med16Q6PGF3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Med16Q6PGF3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Med16Q6PGF3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Med16Q6PGF3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Med16Q6PGF3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Med16Q6PGF3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Med16Q6PGF3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Med16Q6PGF3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Med16Q6PGF3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Med16Q6PGF3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Med16Q6PGF3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Med16Q6PGF3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Med16Q6PGF3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Med16Q6PGF3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Med16Q6PGF3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Med16Q6PGF3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Med16Q6PGF3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Med16Q6PGF3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Med16Q6PGF3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Med16Q6PGF3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Med16Q6PGF3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Med16Q6PGF3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Med16Q6PGF3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Med16Q6PGF3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Med16Q6PGF3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Med16Q6PGF3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Med16Q6PGF3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Med16Q6PGF3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Med16Q6PGF3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Med16Q6PGF3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Med16Q6PGF3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Med16Q6PGF3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Med16Q6PGF3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Med16Q6PGF3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Med16Q6PGF3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms