Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rrp12Q6P5B0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rrp12Q6P5B0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rrp12Q6P5B0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rrp12Q6P5B0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rrp12Q6P5B0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rrp12Q6P5B0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rrp12Q6P5B0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rrp12Q6P5B0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rrp12Q6P5B0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rrp12Q6P5B0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rrp12Q6P5B0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rrp12Q6P5B0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rrp12Q6P5B0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rrp12Q6P5B0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rrp12Q6P5B0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rrp12Q6P5B0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rrp12Q6P5B0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rrp12Q6P5B0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rrp12Q6P5B0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrp12Q6P5B0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrp12Q6P5B0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrp12Q6P5B0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrp12Q6P5B0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrp12Q6P5B0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrp12Q6P5B0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rrp12Q6P5B0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rrp12Q6P5B0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rrp12Q6P5B0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rrp12Q6P5B0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrp12Q6P5B0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrp12Q6P5B0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrp12Q6P5B0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrp12Q6P5B0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rrp12Q6P5B0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrp12Q6P5B0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrp12Q6P5B0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrp12Q6P5B0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rrp12Q6P5B0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rrp12Q6P5B0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rrp12Q6P5B0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rrp12Q6P5B0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rrp12Q6P5B0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rrp12Q6P5B0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rrp12Q6P5B0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rrp12Q6P5B0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rrp12Q6P5B0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rrp12Q6P5B0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rrp12Q6P5B0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rrp12Q6P5B0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rrp12Q6P5B0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rrp12Q6P5B0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rrp12Q6P5B0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rrp12Q6P5B0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rrp12Q6P5B0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rrp12Q6P5B0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rrp12Q6P5B0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rrp12Q6P5B0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rrp12Q6P5B0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rrp12Q6P5B0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rrp12Q6P5B0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rrp12Q6P5B0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rrp12Q6P5B0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rrp12Q6P5B0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rrp12Q6P5B0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rrp12Q6P5B0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rrp12Q6P5B0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rrp12Q6P5B0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rrp12Q6P5B0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rrp12Q6P5B0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rrp12Q6P5B0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rrp12Q6P5B0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rrp12Q6P5B0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rrp12Q6P5B0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rrp12Q6P5B0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rrp12Q6P5B0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rrp12Q6P5B0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rrp12Q6P5B0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rrp12Q6P5B0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rrp12Q6P5B0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rrp12Q6P5B0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rrp12Q6P5B0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rrp12Q6P5B0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rrp12Q6P5B0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rrp12Q6P5B0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rrp12Q6P5B0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rrp12Q6P5B0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rrp12Q6P5B0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rrp12Q6P5B0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rrp12Q6P5B0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rrp12Q6P5B0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rrp12Q6P5B0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rrp12Q6P5B0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rrp12Q6P5B0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rrp12Q6P5B0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rrp12Q6P5B0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rrp12Q6P5B0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Rrp12Q6P5B0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rrp12Q6P5B0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rrp12Q6P5B0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms