Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sik3Q6P4S6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sik3Q6P4S6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sik3Q6P4S6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sik3Q6P4S6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sik3Q6P4S6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sik3Q6P4S6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sik3Q6P4S6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sik3Q6P4S6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sik3Q6P4S6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Sik3Q6P4S6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sik3Q6P4S6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sik3Q6P4S6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sik3Q6P4S6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sik3Q6P4S6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sik3Q6P4S6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sik3Q6P4S6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sik3Q6P4S6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sik3Q6P4S6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sik3Q6P4S6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sik3Q6P4S6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sik3Q6P4S6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sik3Q6P4S6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sik3Q6P4S6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Sik3Q6P4S6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Sik3Q6P4S6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sik3Q6P4S6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sik3Q6P4S6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sik3Q6P4S6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sik3Q6P4S6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sik3Q6P4S6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sik3Q6P4S6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sik3Q6P4S6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sik3Q6P4S6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sik3Q6P4S6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sik3Q6P4S6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sik3Q6P4S6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sik3Q6P4S6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Sik3Q6P4S6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sik3Q6P4S6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sik3Q6P4S6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Sik3Q6P4S6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sik3Q6P4S6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sik3Q6P4S6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sik3Q6P4S6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sik3Q6P4S6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sik3Q6P4S6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sik3Q6P4S6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sik3Q6P4S6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sik3Q6P4S6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sik3Q6P4S6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sik3Q6P4S6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sik3Q6P4S6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sik3Q6P4S6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sik3Q6P4S6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sik3Q6P4S6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sik3Q6P4S6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sik3Q6P4S6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
Sik3Q6P4S6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sik3Q6P4S6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Sik3Q6P4S6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sik3Q6P4S6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sik3Q6P4S6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sik3Q6P4S6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sik3Q6P4S6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Sik3Q6P4S6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sik3Q6P4S6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sik3Q6P4S6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sik3Q6P4S6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sik3Q6P4S6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Sik3Q6P4S6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Sik3Q6P4S6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sik3Q6P4S6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sik3Q6P4S6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sik3Q6P4S6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sik3Q6P4S6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sik3Q6P4S6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sik3Q6P4S6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Sik3Q6P4S6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sik3Q6P4S6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sik3Q6P4S6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sik3Q6P4S6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sik3Q6P4S6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sik3Q6P4S6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sik3Q6P4S6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sik3Q6P4S6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sik3Q6P4S6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sik3Q6P4S6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sik3Q6P4S6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sik3Q6P4S6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sik3Q6P4S6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sik3Q6P4S6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sik3Q6P4S6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sik3Q6P4S6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sik3Q6P4S6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sik3Q6P4S6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sik3Q6P4S6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sik3Q6P4S6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sik3Q6P4S6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sik3Q6P4S6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms