Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Rprd2Q6NXI6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Rprd2Q6NXI6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Rprd2Q6NXI6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Rprd2Q6NXI6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Rprd2Q6NXI6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Rprd2Q6NXI6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Rprd2Q6NXI6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Rprd2Q6NXI6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Rprd2Q6NXI6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Rprd2Q6NXI6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Rprd2Q6NXI6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Rprd2Q6NXI6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Rprd2Q6NXI6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Rprd2Q6NXI6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Rprd2Q6NXI6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Rprd2Q6NXI6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Rprd2Q6NXI6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Rprd2Q6NXI6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Rprd2Q6NXI6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rprd2Q6NXI6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rprd2Q6NXI6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Rprd2Q6NXI6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Rprd2Q6NXI6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Rprd2Q6NXI6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Rprd2Q6NXI6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Rprd2Q6NXI6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Rprd2Q6NXI6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Rprd2Q6NXI6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rprd2Q6NXI6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rprd2Q6NXI6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rprd2Q6NXI6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rprd2Q6NXI6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rprd2Q6NXI6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rprd2Q6NXI6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rprd2Q6NXI6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rprd2Q6NXI6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rprd2Q6NXI6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Rprd2Q6NXI6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Rprd2Q6NXI6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Rprd2Q6NXI6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Rprd2Q6NXI6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Rprd2Q6NXI6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rprd2Q6NXI6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rprd2Q6NXI6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rprd2Q6NXI6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Rprd2Q6NXI6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Rprd2Q6NXI6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Rprd2Q6NXI6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Rprd2Q6NXI6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Rprd2Q6NXI6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Rprd2Q6NXI6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Rprd2Q6NXI6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Rprd2Q6NXI6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Rprd2Q6NXI6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rprd2Q6NXI6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Rprd2Q6NXI6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rprd2Q6NXI6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rprd2Q6NXI6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rprd2Q6NXI6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Rprd2Q6NXI6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Rprd2Q6NXI6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Rprd2Q6NXI6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rprd2Q6NXI6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rprd2Q6NXI6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Rprd2Q6NXI6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Rprd2Q6NXI6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Rprd2Q6NXI6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Rprd2Q6NXI6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Rprd2Q6NXI6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Rprd2Q6NXI6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Rprd2Q6NXI6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rprd2Q6NXI6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rprd2Q6NXI6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rprd2Q6NXI6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rprd2Q6NXI6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rprd2Q6NXI6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Rprd2Q6NXI6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Rprd2Q6NXI6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rprd2Q6NXI6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rprd2Q6NXI6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rprd2Q6NXI6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Rprd2Q6NXI6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Rprd2Q6NXI6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Rprd2Q6NXI6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Rprd2Q6NXI6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Rprd2Q6NXI6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Rprd2Q6NXI6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Rprd2Q6NXI6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rprd2Q6NXI6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rprd2Q6NXI6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rprd2Q6NXI6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rprd2Q6NXI6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rprd2Q6NXI6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Rprd2Q6NXI6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Rprd2Q6NXI6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Rprd2Q6NXI6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Rprd2Q6NXI6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Rprd2Q6NXI6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Rprd2Q6NXI6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms