Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ParpbpQ6IRT3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ParpbpQ6IRT3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ParpbpQ6IRT3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ParpbpQ6IRT3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ParpbpQ6IRT3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ParpbpQ6IRT3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ParpbpQ6IRT3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ParpbpQ6IRT3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ParpbpQ6IRT3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ParpbpQ6IRT3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ParpbpQ6IRT3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ParpbpQ6IRT3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ParpbpQ6IRT3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ParpbpQ6IRT3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ParpbpQ6IRT3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ParpbpQ6IRT3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ParpbpQ6IRT3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ParpbpQ6IRT3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ParpbpQ6IRT3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ParpbpQ6IRT3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ParpbpQ6IRT3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ParpbpQ6IRT3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ParpbpQ6IRT3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ParpbpQ6IRT3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ParpbpQ6IRT3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ParpbpQ6IRT3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ParpbpQ6IRT3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ParpbpQ6IRT3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ParpbpQ6IRT3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ParpbpQ6IRT3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ParpbpQ6IRT3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ParpbpQ6IRT3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ParpbpQ6IRT3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ParpbpQ6IRT3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ParpbpQ6IRT3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ParpbpQ6IRT3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ParpbpQ6IRT3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ParpbpQ6IRT3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ParpbpQ6IRT3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ParpbpQ6IRT3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ParpbpQ6IRT3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ParpbpQ6IRT3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ParpbpQ6IRT3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ParpbpQ6IRT3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ParpbpQ6IRT3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ParpbpQ6IRT3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ParpbpQ6IRT3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ParpbpQ6IRT3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ParpbpQ6IRT3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ParpbpQ6IRT3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ParpbpQ6IRT3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ParpbpQ6IRT3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ParpbpQ6IRT3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ParpbpQ6IRT3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ParpbpQ6IRT3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ParpbpQ6IRT3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ParpbpQ6IRT3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ParpbpQ6IRT3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ParpbpQ6IRT3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ParpbpQ6IRT3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ParpbpQ6IRT3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ParpbpQ6IRT3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ParpbpQ6IRT3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ParpbpQ6IRT3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ParpbpQ6IRT3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ParpbpQ6IRT3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ParpbpQ6IRT3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ParpbpQ6IRT3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ParpbpQ6IRT3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ParpbpQ6IRT3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ParpbpQ6IRT3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ParpbpQ6IRT3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ParpbpQ6IRT3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ParpbpQ6IRT3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ParpbpQ6IRT3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ParpbpQ6IRT3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ParpbpQ6IRT3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ParpbpQ6IRT3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ParpbpQ6IRT3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ParpbpQ6IRT3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ParpbpQ6IRT3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ParpbpQ6IRT3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ParpbpQ6IRT3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ParpbpQ6IRT3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ParpbpQ6IRT3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ParpbpQ6IRT3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ParpbpQ6IRT3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ParpbpQ6IRT3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ParpbpQ6IRT3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ParpbpQ6IRT3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ParpbpQ6IRT3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ParpbpQ6IRT3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ParpbpQ6IRT3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ParpbpQ6IRT3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ParpbpQ6IRT3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ParpbpQ6IRT3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ParpbpQ6IRT3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms