Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hist2h2aa1Q6GSS7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hist2h2aa1Q6GSS7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hist2h2aa1Q6GSS7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hist2h2aa1Q6GSS7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hist2h2aa1Q6GSS7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hist2h2aa1Q6GSS7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hist2h2aa1Q6GSS7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hist2h2aa1Q6GSS7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hist2h2aa1Q6GSS7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hist2h2aa1Q6GSS7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hist2h2aa1Q6GSS7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hist2h2aa1Q6GSS7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hist2h2aa1Q6GSS7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hist2h2aa1Q6GSS7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hist2h2aa1Q6GSS7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hist2h2aa1Q6GSS7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hist2h2aa1Q6GSS7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hist2h2aa1Q6GSS7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hist2h2aa1Q6GSS7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hist2h2aa1Q6GSS7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hist2h2aa1Q6GSS7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hist2h2aa1Q6GSS7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hist2h2aa1Q6GSS7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hist2h2aa1Q6GSS7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hist2h2aa1Q6GSS7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hist2h2aa1Q6GSS7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hist2h2aa1Q6GSS7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms