Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Sbno1Q689Z5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Sbno1Q689Z5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Sbno1Q689Z5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Sbno1Q689Z5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Sbno1Q689Z5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Sbno1Q689Z5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Sbno1Q689Z5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Sbno1Q689Z5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Sbno1Q689Z5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Sbno1Q689Z5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Sbno1Q689Z5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Sbno1Q689Z5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Sbno1Q689Z5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Sbno1Q689Z5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Sbno1Q689Z5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Sbno1Q689Z5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Sbno1Q689Z5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Sbno1Q689Z5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Sbno1Q689Z5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Sbno1Q689Z5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Sbno1Q689Z5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Sbno1Q689Z5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Sbno1Q689Z5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Sbno1Q689Z5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
Sbno1Q689Z5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Sbno1Q689Z5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Sbno1Q689Z5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Sbno1Q689Z5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Sbno1Q689Z5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Sbno1Q689Z5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Sbno1Q689Z5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Sbno1Q689Z5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Sbno1Q689Z5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Sbno1Q689Z5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Sbno1Q689Z5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
Sbno1Q689Z5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Sbno1Q689Z5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Sbno1Q689Z5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Sbno1Q689Z5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Sbno1Q689Z5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Sbno1Q689Z5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Sbno1Q689Z5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Sbno1Q689Z5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Sbno1Q689Z5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Sbno1Q689Z5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Sbno1Q689Z5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Sbno1Q689Z5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Sbno1Q689Z5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Sbno1Q689Z5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Sbno1Q689Z5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Sbno1Q689Z5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Sbno1Q689Z5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Sbno1Q689Z5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Sbno1Q689Z5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Sbno1Q689Z5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Sbno1Q689Z5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Sbno1Q689Z5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Sbno1Q689Z5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Sbno1Q689Z5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Sbno1Q689Z5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Sbno1Q689Z5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Sbno1Q689Z5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Sbno1Q689Z5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sbno1Q689Z5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sbno1Q689Z5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sbno1Q689Z5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Sbno1Q689Z5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Sbno1Q689Z5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Sbno1Q689Z5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
Sbno1Q689Z5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Sbno1Q689Z5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Sbno1Q689Z5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Sbno1Q689Z5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Sbno1Q689Z5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Sbno1Q689Z5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Sbno1Q689Z5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Sbno1Q689Z5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Sbno1Q689Z5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Sbno1Q689Z5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Sbno1Q689Z5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Sbno1Q689Z5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Sbno1Q689Z5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Sbno1Q689Z5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Sbno1Q689Z5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Sbno1Q689Z5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Sbno1Q689Z5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Sbno1Q689Z5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Sbno1Q689Z5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Sbno1Q689Z5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Sbno1Q689Z5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Sbno1Q689Z5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Sbno1Q689Z5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Sbno1Q689Z5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Sbno1Q689Z5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Sbno1Q689Z5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Sbno1Q689Z5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Sbno1Q689Z5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Sbno1Q689Z5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
Sbno1Q689Z5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms