Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr2kQ63871 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr2kQ63871 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr2kQ63871 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr2kQ63871 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr2kQ63871 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr2kQ63871 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr2kQ63871 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr2kQ63871 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr2kQ63871 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr2kQ63871 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr2kQ63871 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr2kQ63871 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr2kQ63871 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr2kQ63871 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr2kQ63871 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr2kQ63871 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr2kQ63871 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr2kQ63871 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr2kQ63871 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr2kQ63871 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr2kQ63871 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr2kQ63871 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr2kQ63871 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr2kQ63871 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr2kQ63871 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr2kQ63871 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr2kQ63871 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr2kQ63871 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr2kQ63871 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr2kQ63871 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr2kQ63871 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr2kQ63871 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr2kQ63871 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr2kQ63871 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr2kQ63871 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2kQ63871 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2kQ63871 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2kQ63871 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2kQ63871 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2kQ63871 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2kQ63871 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2kQ63871 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr2kQ63871 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr2kQ63871 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2kQ63871 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2kQ63871 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr2kQ63871 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2kQ63871 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2kQ63871 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2kQ63871 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2kQ63871 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2kQ63871 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2kQ63871 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr2kQ63871 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2kQ63871 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2kQ63871 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2kQ63871 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2kQ63871 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2kQ63871 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2kQ63871 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2kQ63871 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2kQ63871 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr2kQ63871 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr2kQ63871 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr2kQ63871 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr2kQ63871 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2kQ63871 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr2kQ63871 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms