Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epha6Q62413 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epha6Q62413 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Epha6Q62413 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Epha6Q62413 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epha6Q62413 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epha6Q62413 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epha6Q62413 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epha6Q62413 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epha6Q62413 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epha6Q62413 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epha6Q62413 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epha6Q62413 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epha6Q62413 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Epha6Q62413 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epha6Q62413 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epha6Q62413 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epha6Q62413 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Epha6Q62413 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Epha6Q62413 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Epha6Q62413 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Epha6Q62413 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epha6Q62413 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epha6Q62413 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epha6Q62413 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epha6Q62413 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epha6Q62413 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epha6Q62413 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epha6Q62413 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Epha6Q62413 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epha6Q62413 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epha6Q62413 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epha6Q62413 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Epha6Q62413 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Epha6Q62413 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Epha6Q62413 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Epha6Q62413 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Epha6Q62413 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Epha6Q62413 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Epha6Q62413 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Epha6Q62413 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Epha6Q62413 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Epha6Q62413 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Epha6Q62413 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epha6Q62413 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epha6Q62413 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epha6Q62413 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Epha6Q62413 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Epha6Q62413 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epha6Q62413 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epha6Q62413 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epha6Q62413 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epha6Q62413 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epha6Q62413 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epha6Q62413 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epha6Q62413 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epha6Q62413 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epha6Q62413 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epha6Q62413 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epha6Q62413 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Epha6Q62413 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Epha6Q62413 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Epha6Q62413 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Epha6Q62413 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Epha6Q62413 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Epha6Q62413 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Epha6Q62413 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epha6Q62413 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epha6Q62413 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms