Protein–RNA interactions for Protein: Q62270

Srms, Tyrosine-protein kinase Srms, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmsQ62270 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrmsQ62270 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrmsQ62270 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrmsQ62270 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrmsQ62270 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrmsQ62270 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrmsQ62270 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrmsQ62270 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrmsQ62270 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrmsQ62270 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrmsQ62270 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrmsQ62270 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SrmsQ62270 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SrmsQ62270 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SrmsQ62270 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SrmsQ62270 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrmsQ62270 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrmsQ62270 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrmsQ62270 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrmsQ62270 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrmsQ62270 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SrmsQ62270 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrmsQ62270 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrmsQ62270 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrmsQ62270 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrmsQ62270 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrmsQ62270 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrmsQ62270 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrmsQ62270 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrmsQ62270 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrmsQ62270 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrmsQ62270 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrmsQ62270 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrmsQ62270 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrmsQ62270 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SrmsQ62270 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrmsQ62270 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SrmsQ62270 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrmsQ62270 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrmsQ62270 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrmsQ62270 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrmsQ62270 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrmsQ62270 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrmsQ62270 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrmsQ62270 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrmsQ62270 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrmsQ62270 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrmsQ62270 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrmsQ62270 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SrmsQ62270 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrmsQ62270 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrmsQ62270 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrmsQ62270 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrmsQ62270 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrmsQ62270 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrmsQ62270 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrmsQ62270 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrmsQ62270 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrmsQ62270 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrmsQ62270 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrmsQ62270 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrmsQ62270 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrmsQ62270 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrmsQ62270 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrmsQ62270 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SrmsQ62270 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrmsQ62270 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrmsQ62270 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrmsQ62270 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrmsQ62270 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrmsQ62270 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrmsQ62270 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrmsQ62270 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms