Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kpna1Q60960 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kpna1Q60960 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kpna1Q60960 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kpna1Q60960 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kpna1Q60960 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Kpna1Q60960 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Kpna1Q60960 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kpna1Q60960 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kpna1Q60960 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kpna1Q60960 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kpna1Q60960 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kpna1Q60960 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kpna1Q60960 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kpna1Q60960 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kpna1Q60960 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kpna1Q60960 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kpna1Q60960 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kpna1Q60960 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kpna1Q60960 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kpna1Q60960 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kpna1Q60960 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kpna1Q60960 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kpna1Q60960 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kpna1Q60960 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kpna1Q60960 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kpna1Q60960 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kpna1Q60960 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kpna1Q60960 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kpna1Q60960 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kpna1Q60960 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kpna1Q60960 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kpna1Q60960 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kpna1Q60960 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kpna1Q60960 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kpna1Q60960 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kpna1Q60960 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kpna1Q60960 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kpna1Q60960 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kpna1Q60960 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Kpna1Q60960 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kpna1Q60960 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kpna1Q60960 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Kpna1Q60960 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kpna1Q60960 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kpna1Q60960 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kpna1Q60960 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kpna1Q60960 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kpna1Q60960 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kpna1Q60960 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kpna1Q60960 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Kpna1Q60960 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kpna1Q60960 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kpna1Q60960 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Kpna1Q60960 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kpna1Q60960 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kpna1Q60960 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kpna1Q60960 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kpna1Q60960 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kpna1Q60960 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kpna1Q60960 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kpna1Q60960 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kpna1Q60960 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kpna1Q60960 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Kpna1Q60960 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kpna1Q60960 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kpna1Q60960 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kpna1Q60960 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kpna1Q60960 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kpna1Q60960 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kpna1Q60960 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kpna1Q60960 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kpna1Q60960 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kpna1Q60960 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kpna1Q60960 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Kpna1Q60960 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kpna1Q60960 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kpna1Q60960 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kpna1Q60960 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kpna1Q60960 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kpna1Q60960 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Kpna1Q60960 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kpna1Q60960 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kpna1Q60960 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kpna1Q60960 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kpna1Q60960 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kpna1Q60960 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kpna1Q60960 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kpna1Q60960 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kpna1Q60960 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kpna1Q60960 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kpna1Q60960 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kpna1Q60960 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kpna1Q60960 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Kpna1Q60960 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kpna1Q60960 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Kpna1Q60960 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kpna1Q60960 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kpna1Q60960 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kpna1Q60960 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms