Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Meis1Q60954 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Meis1Q60954 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Meis1Q60954 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Meis1Q60954 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Meis1Q60954 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Meis1Q60954 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Meis1Q60954 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Meis1Q60954 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Meis1Q60954 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Meis1Q60954 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Meis1Q60954 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Meis1Q60954 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Meis1Q60954 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Meis1Q60954 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Meis1Q60954 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Meis1Q60954 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Meis1Q60954 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Meis1Q60954 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Meis1Q60954 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Meis1Q60954 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Meis1Q60954 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Meis1Q60954 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Meis1Q60954 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Meis1Q60954 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Meis1Q60954 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Meis1Q60954 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Meis1Q60954 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Meis1Q60954 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Meis1Q60954 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Meis1Q60954 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Meis1Q60954 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Meis1Q60954 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Meis1Q60954 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Meis1Q60954 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Meis1Q60954 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Meis1Q60954 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Meis1Q60954 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Meis1Q60954 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Meis1Q60954 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Meis1Q60954 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Meis1Q60954 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Meis1Q60954 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Meis1Q60954 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Meis1Q60954 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Meis1Q60954 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Meis1Q60954 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Meis1Q60954 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Meis1Q60954 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Meis1Q60954 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Meis1Q60954 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Meis1Q60954 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Meis1Q60954 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Meis1Q60954 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Meis1Q60954 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Meis1Q60954 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Meis1Q60954 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Meis1Q60954 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Meis1Q60954 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Meis1Q60954 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Meis1Q60954 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Meis1Q60954 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Meis1Q60954 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Meis1Q60954 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Meis1Q60954 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Meis1Q60954 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Meis1Q60954 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Meis1Q60954 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Meis1Q60954 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Meis1Q60954 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Meis1Q60954 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Meis1Q60954 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Meis1Q60954 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Meis1Q60954 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Meis1Q60954 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Meis1Q60954 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Meis1Q60954 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Meis1Q60954 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Meis1Q60954 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Meis1Q60954 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Meis1Q60954 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Meis1Q60954 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Meis1Q60954 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Meis1Q60954 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Meis1Q60954 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Meis1Q60954 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Meis1Q60954 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Meis1Q60954 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Meis1Q60954 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Meis1Q60954 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Meis1Q60954 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Meis1Q60954 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Meis1Q60954 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Meis1Q60954 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Meis1Q60954 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Meis1Q60954 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Meis1Q60954 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Meis1Q60954 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Meis1Q60954 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Meis1Q60954 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms