Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc125Q5U465 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc125Q5U465 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc125Q5U465 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc125Q5U465 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc125Q5U465 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc125Q5U465 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc125Q5U465 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc125Q5U465 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc125Q5U465 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc125Q5U465 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc125Q5U465 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc125Q5U465 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc125Q5U465 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc125Q5U465 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc125Q5U465 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc125Q5U465 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc125Q5U465 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc125Q5U465 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc125Q5U465 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc125Q5U465 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc125Q5U465 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc125Q5U465 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms