Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rtl5Q5DTT4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rtl5Q5DTT4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rtl5Q5DTT4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rtl5Q5DTT4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rtl5Q5DTT4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Rtl5Q5DTT4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rtl5Q5DTT4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Rtl5Q5DTT4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rtl5Q5DTT4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rtl5Q5DTT4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rtl5Q5DTT4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rtl5Q5DTT4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rtl5Q5DTT4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rtl5Q5DTT4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Rtl5Q5DTT4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rtl5Q5DTT4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rtl5Q5DTT4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rtl5Q5DTT4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rtl5Q5DTT4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rtl5Q5DTT4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rtl5Q5DTT4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rtl5Q5DTT4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rtl5Q5DTT4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rtl5Q5DTT4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rtl5Q5DTT4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rtl5Q5DTT4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rtl5Q5DTT4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rtl5Q5DTT4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rtl5Q5DTT4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Rtl5Q5DTT4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rtl5Q5DTT4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rtl5Q5DTT4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rtl5Q5DTT4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rtl5Q5DTT4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rtl5Q5DTT4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rtl5Q5DTT4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rtl5Q5DTT4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rtl5Q5DTT4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rtl5Q5DTT4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rtl5Q5DTT4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rtl5Q5DTT4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rtl5Q5DTT4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rtl5Q5DTT4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rtl5Q5DTT4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rtl5Q5DTT4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Rtl5Q5DTT4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rtl5Q5DTT4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rtl5Q5DTT4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rtl5Q5DTT4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rtl5Q5DTT4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rtl5Q5DTT4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rtl5Q5DTT4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rtl5Q5DTT4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rtl5Q5DTT4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rtl5Q5DTT4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rtl5Q5DTT4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rtl5Q5DTT4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Rtl5Q5DTT4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rtl5Q5DTT4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rtl5Q5DTT4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rtl5Q5DTT4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rtl5Q5DTT4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rtl5Q5DTT4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rtl5Q5DTT4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rtl5Q5DTT4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rtl5Q5DTT4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rtl5Q5DTT4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rtl5Q5DTT4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rtl5Q5DTT4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rtl5Q5DTT4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rtl5Q5DTT4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rtl5Q5DTT4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rtl5Q5DTT4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rtl5Q5DTT4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Rtl5Q5DTT4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Rtl5Q5DTT4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rtl5Q5DTT4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rtl5Q5DTT4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rtl5Q5DTT4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rtl5Q5DTT4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rtl5Q5DTT4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rtl5Q5DTT4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rtl5Q5DTT4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rtl5Q5DTT4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rtl5Q5DTT4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rtl5Q5DTT4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rtl5Q5DTT4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rtl5Q5DTT4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rtl5Q5DTT4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rtl5Q5DTT4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rtl5Q5DTT4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rtl5Q5DTT4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rtl5Q5DTT4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rtl5Q5DTT4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rtl5Q5DTT4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rtl5Q5DTT4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rtl5Q5DTT4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rtl5Q5DTT4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rtl5Q5DTT4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms