Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLK4

Zcchc6, Terminal uridylyltransferase 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc6Q5BLK4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC45.26■■■■■ 4.84
Zcchc6Q5BLK4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC45.26■■■■■ 4.84
Zcchc6Q5BLK4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC45.25■■■■■ 4.83
Zcchc6Q5BLK4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
Zcchc6Q5BLK4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
Zcchc6Q5BLK4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
Zcchc6Q5BLK4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC45.22■■■■■ 4.83
Zcchc6Q5BLK4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC45.21■■■■■ 4.83
Zcchc6Q5BLK4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC45.2■■■■■ 4.83
Zcchc6Q5BLK4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC45.19■■■■■ 4.82
Zcchc6Q5BLK4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
Zcchc6Q5BLK4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
Zcchc6Q5BLK4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC45.16■■■■■ 4.82
Zcchc6Q5BLK4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
Zcchc6Q5BLK4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
Zcchc6Q5BLK4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.15■■■■■ 4.82
Zcchc6Q5BLK4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
Zcchc6Q5BLK4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.14■■■■■ 4.82
Zcchc6Q5BLK4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC45.14■■■■■ 4.82
Zcchc6Q5BLK4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
Zcchc6Q5BLK4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
Zcchc6Q5BLK4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
Zcchc6Q5BLK4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC45.08■■■■■ 4.81
Zcchc6Q5BLK4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
Zcchc6Q5BLK4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
Zcchc6Q5BLK4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
Zcchc6Q5BLK4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Zcchc6Q5BLK4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Zcchc6Q5BLK4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
Zcchc6Q5BLK4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
Zcchc6Q5BLK4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
Zcchc6Q5BLK4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
Zcchc6Q5BLK4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
Zcchc6Q5BLK4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
Zcchc6Q5BLK4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
Zcchc6Q5BLK4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC44.95■■■■■ 4.79
Zcchc6Q5BLK4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
Zcchc6Q5BLK4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
Zcchc6Q5BLK4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC44.89■■■■■ 4.78
Zcchc6Q5BLK4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
Zcchc6Q5BLK4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC44.89■■■■■ 4.78
Zcchc6Q5BLK4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
Zcchc6Q5BLK4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
Zcchc6Q5BLK4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
Zcchc6Q5BLK4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.77
Zcchc6Q5BLK4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
Zcchc6Q5BLK4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
Zcchc6Q5BLK4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
Zcchc6Q5BLK4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC44.8■■■■■ 4.76
Zcchc6Q5BLK4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
Zcchc6Q5BLK4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
Zcchc6Q5BLK4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC44.78■■■■■ 4.76
Zcchc6Q5BLK4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
Zcchc6Q5BLK4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
Zcchc6Q5BLK4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
Zcchc6Q5BLK4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC44.72■■■■■ 4.75
Zcchc6Q5BLK4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Zcchc6Q5BLK4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
Zcchc6Q5BLK4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
Zcchc6Q5BLK4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
Zcchc6Q5BLK4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
Zcchc6Q5BLK4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
Zcchc6Q5BLK4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.63■■■■■ 4.73
Zcchc6Q5BLK4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
Zcchc6Q5BLK4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
Zcchc6Q5BLK4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC44.62■■■■■ 4.73
Zcchc6Q5BLK4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
Zcchc6Q5BLK4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
Zcchc6Q5BLK4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
Zcchc6Q5BLK4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
Zcchc6Q5BLK4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
Zcchc6Q5BLK4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC44.6■■■■■ 4.73
Zcchc6Q5BLK4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
Zcchc6Q5BLK4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
Zcchc6Q5BLK4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
Zcchc6Q5BLK4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC44.59■■■■■ 4.73
Zcchc6Q5BLK4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
Zcchc6Q5BLK4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
Zcchc6Q5BLK4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
Zcchc6Q5BLK4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC44.56■■■■■ 4.72
Zcchc6Q5BLK4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
Zcchc6Q5BLK4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
Zcchc6Q5BLK4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
Zcchc6Q5BLK4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Zcchc6Q5BLK4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.54■■■■■ 4.72
Zcchc6Q5BLK4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
Zcchc6Q5BLK4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
Zcchc6Q5BLK4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC44.51■■■■■ 4.72
Zcchc6Q5BLK4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
Zcchc6Q5BLK4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Zcchc6Q5BLK4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
Zcchc6Q5BLK4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
Zcchc6Q5BLK4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Zcchc6Q5BLK4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
Zcchc6Q5BLK4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
Zcchc6Q5BLK4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
Zcchc6Q5BLK4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Zcchc6Q5BLK4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
Zcchc6Q5BLK4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC44.44■■■■■ 4.7
Zcchc6Q5BLK4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms