Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2al1nQ497L1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2al1nQ497L1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2al1nQ497L1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2al1nQ497L1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2al1nQ497L1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2al1nQ497L1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2al1nQ497L1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2al1nQ497L1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2al1nQ497L1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2al1nQ497L1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2al1nQ497L1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2al1nQ497L1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2al1nQ497L1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2al1nQ497L1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2al1nQ497L1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2al1nQ497L1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2al1nQ497L1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2al1nQ497L1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2al1nQ497L1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2al1nQ497L1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2al1nQ497L1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2al1nQ497L1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2al1nQ497L1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2al1nQ497L1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2al1nQ497L1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2al1nQ497L1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al1nQ497L1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al1nQ497L1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al1nQ497L1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al1nQ497L1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al1nQ497L1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al1nQ497L1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al1nQ497L1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al1nQ497L1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2al1nQ497L1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2al1nQ497L1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2al1nQ497L1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2al1nQ497L1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2al1nQ497L1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2al1nQ497L1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2al1nQ497L1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2al1nQ497L1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2al1nQ497L1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2al1nQ497L1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2al1nQ497L1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2al1nQ497L1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2al1nQ497L1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2al1nQ497L1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2al1nQ497L1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2al1nQ497L1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2al1nQ497L1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2al1nQ497L1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2al1nQ497L1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2al1nQ497L1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2al1nQ497L1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2al1nQ497L1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2al1nQ497L1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2al1nQ497L1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2al1nQ497L1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2al1nQ497L1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2al1nQ497L1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2al1nQ497L1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2al1nQ497L1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2al1nQ497L1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2al1nQ497L1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2al1nQ497L1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2al1nQ497L1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms