Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm29609Q3UU56 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm29609Q3UU56 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm29609Q3UU56 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm29609Q3UU56 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm29609Q3UU56 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm29609Q3UU56 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm29609Q3UU56 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm29609Q3UU56 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm29609Q3UU56 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm29609Q3UU56 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm29609Q3UU56 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm29609Q3UU56 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm29609Q3UU56 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm29609Q3UU56 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm29609Q3UU56 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm29609Q3UU56 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm29609Q3UU56 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm29609Q3UU56 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm29609Q3UU56 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm29609Q3UU56 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm29609Q3UU56 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm29609Q3UU56 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm29609Q3UU56 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm29609Q3UU56 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm29609Q3UU56 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm29609Q3UU56 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm29609Q3UU56 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm29609Q3UU56 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm29609Q3UU56 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm29609Q3UU56 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm29609Q3UU56 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm29609Q3UU56 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm29609Q3UU56 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm29609Q3UU56 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm29609Q3UU56 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm29609Q3UU56 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm29609Q3UU56 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm29609Q3UU56 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm29609Q3UU56 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm29609Q3UU56 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm29609Q3UU56 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm29609Q3UU56 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm29609Q3UU56 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm29609Q3UU56 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm29609Q3UU56 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm29609Q3UU56 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm29609Q3UU56 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm29609Q3UU56 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm29609Q3UU56 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm29609Q3UU56 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm29609Q3UU56 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm29609Q3UU56 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm29609Q3UU56 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm29609Q3UU56 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm29609Q3UU56 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm29609Q3UU56 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm29609Q3UU56 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm29609Q3UU56 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm29609Q3UU56 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm29609Q3UU56 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm29609Q3UU56 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm29609Q3UU56 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm29609Q3UU56 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm29609Q3UU56 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm29609Q3UU56 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm29609Q3UU56 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm29609Q3UU56 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm29609Q3UU56 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm29609Q3UU56 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm29609Q3UU56 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm29609Q3UU56 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm29609Q3UU56 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm29609Q3UU56 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm29609Q3UU56 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm29609Q3UU56 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm29609Q3UU56 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gm29609Q3UU56 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gm29609Q3UU56 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm29609Q3UU56 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm29609Q3UU56 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm29609Q3UU56 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm29609Q3UU56 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm29609Q3UU56 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm29609Q3UU56 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm29609Q3UU56 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm29609Q3UU56 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm29609Q3UU56 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm29609Q3UU56 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm29609Q3UU56 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm29609Q3UU56 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm29609Q3UU56 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm29609Q3UU56 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm29609Q3UU56 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm29609Q3UU56 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm29609Q3UU56 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm29609Q3UU56 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm29609Q3UU56 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm29609Q3UU56 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm29609Q3UU56 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms