Protein–RNA interactions for Protein: Q3URQ4

Fam8a1, Family with sequence similarity 8, member A1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam8a1Q3URQ4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam8a1Q3URQ4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam8a1Q3URQ4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam8a1Q3URQ4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam8a1Q3URQ4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam8a1Q3URQ4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam8a1Q3URQ4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam8a1Q3URQ4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam8a1Q3URQ4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam8a1Q3URQ4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam8a1Q3URQ4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fam8a1Q3URQ4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam8a1Q3URQ4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam8a1Q3URQ4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam8a1Q3URQ4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam8a1Q3URQ4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam8a1Q3URQ4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam8a1Q3URQ4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam8a1Q3URQ4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam8a1Q3URQ4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam8a1Q3URQ4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam8a1Q3URQ4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam8a1Q3URQ4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam8a1Q3URQ4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam8a1Q3URQ4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam8a1Q3URQ4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam8a1Q3URQ4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam8a1Q3URQ4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam8a1Q3URQ4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam8a1Q3URQ4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam8a1Q3URQ4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam8a1Q3URQ4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam8a1Q3URQ4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam8a1Q3URQ4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam8a1Q3URQ4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms