Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vwa5b2Q3UR50 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vwa5b2Q3UR50 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vwa5b2Q3UR50 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vwa5b2Q3UR50 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vwa5b2Q3UR50 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Vwa5b2Q3UR50 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vwa5b2Q3UR50 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vwa5b2Q3UR50 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vwa5b2Q3UR50 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vwa5b2Q3UR50 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vwa5b2Q3UR50 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vwa5b2Q3UR50 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vwa5b2Q3UR50 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vwa5b2Q3UR50 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vwa5b2Q3UR50 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vwa5b2Q3UR50 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vwa5b2Q3UR50 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vwa5b2Q3UR50 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vwa5b2Q3UR50 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vwa5b2Q3UR50 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vwa5b2Q3UR50 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vwa5b2Q3UR50 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vwa5b2Q3UR50 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vwa5b2Q3UR50 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vwa5b2Q3UR50 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vwa5b2Q3UR50 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vwa5b2Q3UR50 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vwa5b2Q3UR50 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vwa5b2Q3UR50 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vwa5b2Q3UR50 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vwa5b2Q3UR50 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vwa5b2Q3UR50 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vwa5b2Q3UR50 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vwa5b2Q3UR50 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vwa5b2Q3UR50 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vwa5b2Q3UR50 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vwa5b2Q3UR50 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vwa5b2Q3UR50 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vwa5b2Q3UR50 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vwa5b2Q3UR50 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vwa5b2Q3UR50 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vwa5b2Q3UR50 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vwa5b2Q3UR50 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vwa5b2Q3UR50 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vwa5b2Q3UR50 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vwa5b2Q3UR50 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vwa5b2Q3UR50 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vwa5b2Q3UR50 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vwa5b2Q3UR50 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vwa5b2Q3UR50 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vwa5b2Q3UR50 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vwa5b2Q3UR50 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vwa5b2Q3UR50 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vwa5b2Q3UR50 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vwa5b2Q3UR50 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vwa5b2Q3UR50 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vwa5b2Q3UR50 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vwa5b2Q3UR50 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vwa5b2Q3UR50 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vwa5b2Q3UR50 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vwa5b2Q3UR50 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vwa5b2Q3UR50 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vwa5b2Q3UR50 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vwa5b2Q3UR50 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vwa5b2Q3UR50 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vwa5b2Q3UR50 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vwa5b2Q3UR50 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vwa5b2Q3UR50 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vwa5b2Q3UR50 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vwa5b2Q3UR50 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vwa5b2Q3UR50 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vwa5b2Q3UR50 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vwa5b2Q3UR50 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vwa5b2Q3UR50 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vwa5b2Q3UR50 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vwa5b2Q3UR50 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vwa5b2Q3UR50 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vwa5b2Q3UR50 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vwa5b2Q3UR50 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vwa5b2Q3UR50 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vwa5b2Q3UR50 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa5b2Q3UR50 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa5b2Q3UR50 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa5b2Q3UR50 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vwa5b2Q3UR50 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa5b2Q3UR50 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa5b2Q3UR50 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa5b2Q3UR50 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa5b2Q3UR50 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vwa5b2Q3UR50 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vwa5b2Q3UR50 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vwa5b2Q3UR50 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa5b2Q3UR50 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vwa5b2Q3UR50 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vwa5b2Q3UR50 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa5b2Q3UR50 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa5b2Q3UR50 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vwa5b2Q3UR50 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vwa5b2Q3UR50 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms