Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem253Q3UNB8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem253Q3UNB8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmem253Q3UNB8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem253Q3UNB8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem253Q3UNB8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem253Q3UNB8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem253Q3UNB8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem253Q3UNB8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem253Q3UNB8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem253Q3UNB8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem253Q3UNB8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem253Q3UNB8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem253Q3UNB8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem253Q3UNB8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem253Q3UNB8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem253Q3UNB8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem253Q3UNB8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmem253Q3UNB8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem253Q3UNB8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem253Q3UNB8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem253Q3UNB8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem253Q3UNB8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem253Q3UNB8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem253Q3UNB8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem253Q3UNB8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem253Q3UNB8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem253Q3UNB8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem253Q3UNB8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem253Q3UNB8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem253Q3UNB8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem253Q3UNB8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem253Q3UNB8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem253Q3UNB8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem253Q3UNB8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem253Q3UNB8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem253Q3UNB8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem253Q3UNB8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem253Q3UNB8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem253Q3UNB8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem253Q3UNB8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem253Q3UNB8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem253Q3UNB8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem253Q3UNB8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem253Q3UNB8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem253Q3UNB8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem253Q3UNB8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem253Q3UNB8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem253Q3UNB8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem253Q3UNB8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem253Q3UNB8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem253Q3UNB8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem253Q3UNB8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem253Q3UNB8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem253Q3UNB8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem253Q3UNB8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem253Q3UNB8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem253Q3UNB8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem253Q3UNB8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem253Q3UNB8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem253Q3UNB8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem253Q3UNB8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem253Q3UNB8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem253Q3UNB8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem253Q3UNB8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem253Q3UNB8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem253Q3UNB8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem253Q3UNB8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem253Q3UNB8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem253Q3UNB8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem253Q3UNB8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem253Q3UNB8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem253Q3UNB8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem253Q3UNB8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem253Q3UNB8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem253Q3UNB8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem253Q3UNB8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem253Q3UNB8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem253Q3UNB8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem253Q3UNB8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem253Q3UNB8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem253Q3UNB8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem253Q3UNB8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem253Q3UNB8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem253Q3UNB8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem253Q3UNB8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem253Q3UNB8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem253Q3UNB8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem253Q3UNB8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem253Q3UNB8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem253Q3UNB8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem253Q3UNB8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem253Q3UNB8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem253Q3UNB8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem253Q3UNB8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem253Q3UNB8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem253Q3UNB8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem253Q3UNB8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem253Q3UNB8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem253Q3UNB8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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