Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cobll1Q3UMF0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cobll1Q3UMF0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cobll1Q3UMF0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cobll1Q3UMF0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cobll1Q3UMF0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cobll1Q3UMF0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cobll1Q3UMF0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cobll1Q3UMF0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cobll1Q3UMF0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cobll1Q3UMF0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cobll1Q3UMF0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cobll1Q3UMF0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cobll1Q3UMF0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cobll1Q3UMF0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cobll1Q3UMF0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cobll1Q3UMF0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cobll1Q3UMF0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cobll1Q3UMF0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cobll1Q3UMF0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cobll1Q3UMF0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cobll1Q3UMF0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cobll1Q3UMF0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cobll1Q3UMF0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cobll1Q3UMF0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cobll1Q3UMF0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cobll1Q3UMF0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cobll1Q3UMF0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cobll1Q3UMF0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cobll1Q3UMF0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cobll1Q3UMF0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cobll1Q3UMF0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cobll1Q3UMF0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cobll1Q3UMF0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cobll1Q3UMF0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cobll1Q3UMF0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cobll1Q3UMF0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cobll1Q3UMF0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cobll1Q3UMF0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cobll1Q3UMF0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cobll1Q3UMF0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cobll1Q3UMF0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cobll1Q3UMF0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cobll1Q3UMF0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cobll1Q3UMF0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cobll1Q3UMF0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cobll1Q3UMF0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cobll1Q3UMF0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cobll1Q3UMF0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cobll1Q3UMF0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cobll1Q3UMF0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cobll1Q3UMF0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cobll1Q3UMF0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cobll1Q3UMF0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cobll1Q3UMF0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cobll1Q3UMF0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cobll1Q3UMF0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cobll1Q3UMF0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cobll1Q3UMF0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cobll1Q3UMF0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cobll1Q3UMF0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cobll1Q3UMF0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cobll1Q3UMF0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cobll1Q3UMF0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cobll1Q3UMF0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cobll1Q3UMF0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cobll1Q3UMF0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cobll1Q3UMF0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cobll1Q3UMF0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cobll1Q3UMF0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cobll1Q3UMF0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cobll1Q3UMF0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cobll1Q3UMF0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cobll1Q3UMF0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cobll1Q3UMF0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cobll1Q3UMF0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cobll1Q3UMF0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cobll1Q3UMF0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cobll1Q3UMF0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cobll1Q3UMF0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cobll1Q3UMF0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cobll1Q3UMF0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cobll1Q3UMF0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cobll1Q3UMF0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cobll1Q3UMF0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cobll1Q3UMF0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cobll1Q3UMF0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cobll1Q3UMF0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cobll1Q3UMF0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cobll1Q3UMF0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cobll1Q3UMF0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cobll1Q3UMF0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cobll1Q3UMF0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cobll1Q3UMF0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cobll1Q3UMF0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cobll1Q3UMF0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cobll1Q3UMF0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cobll1Q3UMF0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cobll1Q3UMF0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cobll1Q3UMF0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms