Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E330014E10RikQ3UL33 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E330014E10RikQ3UL33 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E330014E10RikQ3UL33 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E330014E10RikQ3UL33 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E330014E10RikQ3UL33 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E330014E10RikQ3UL33 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E330014E10RikQ3UL33 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E330014E10RikQ3UL33 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E330014E10RikQ3UL33 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E330014E10RikQ3UL33 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E330014E10RikQ3UL33 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E330014E10RikQ3UL33 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
E330014E10RikQ3UL33 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E330014E10RikQ3UL33 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E330014E10RikQ3UL33 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E330014E10RikQ3UL33 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E330014E10RikQ3UL33 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E330014E10RikQ3UL33 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E330014E10RikQ3UL33 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E330014E10RikQ3UL33 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E330014E10RikQ3UL33 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E330014E10RikQ3UL33 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
E330014E10RikQ3UL33 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
E330014E10RikQ3UL33 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E330014E10RikQ3UL33 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E330014E10RikQ3UL33 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E330014E10RikQ3UL33 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E330014E10RikQ3UL33 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E330014E10RikQ3UL33 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E330014E10RikQ3UL33 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E330014E10RikQ3UL33 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E330014E10RikQ3UL33 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E330014E10RikQ3UL33 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E330014E10RikQ3UL33 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
E330014E10RikQ3UL33 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E330014E10RikQ3UL33 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E330014E10RikQ3UL33 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E330014E10RikQ3UL33 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E330014E10RikQ3UL33 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E330014E10RikQ3UL33 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E330014E10RikQ3UL33 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E330014E10RikQ3UL33 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E330014E10RikQ3UL33 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E330014E10RikQ3UL33 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E330014E10RikQ3UL33 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E330014E10RikQ3UL33 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E330014E10RikQ3UL33 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E330014E10RikQ3UL33 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E330014E10RikQ3UL33 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E330014E10RikQ3UL33 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
E330014E10RikQ3UL33 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E330014E10RikQ3UL33 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E330014E10RikQ3UL33 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E330014E10RikQ3UL33 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E330014E10RikQ3UL33 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
E330014E10RikQ3UL33 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
E330014E10RikQ3UL33 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
E330014E10RikQ3UL33 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E330014E10RikQ3UL33 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
E330014E10RikQ3UL33 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
E330014E10RikQ3UL33 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
E330014E10RikQ3UL33 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E330014E10RikQ3UL33 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E330014E10RikQ3UL33 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
E330014E10RikQ3UL33 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E330014E10RikQ3UL33 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E330014E10RikQ3UL33 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E330014E10RikQ3UL33 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
E330014E10RikQ3UL33 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E330014E10RikQ3UL33 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E330014E10RikQ3UL33 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
E330014E10RikQ3UL33 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E330014E10RikQ3UL33 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E330014E10RikQ3UL33 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E330014E10RikQ3UL33 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E330014E10RikQ3UL33 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E330014E10RikQ3UL33 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E330014E10RikQ3UL33 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E330014E10RikQ3UL33 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
E330014E10RikQ3UL33 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E330014E10RikQ3UL33 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E330014E10RikQ3UL33 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E330014E10RikQ3UL33 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E330014E10RikQ3UL33 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E330014E10RikQ3UL33 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E330014E10RikQ3UL33 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E330014E10RikQ3UL33 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E330014E10RikQ3UL33 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E330014E10RikQ3UL33 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E330014E10RikQ3UL33 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
E330014E10RikQ3UL33 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E330014E10RikQ3UL33 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E330014E10RikQ3UL33 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
E330014E10RikQ3UL33 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E330014E10RikQ3UL33 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E330014E10RikQ3UL33 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E330014E10RikQ3UL33 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E330014E10RikQ3UL33 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E330014E10RikQ3UL33 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms