Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKP4

Ceacam12, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam12Q3UKP4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ceacam12Q3UKP4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ceacam12Q3UKP4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ceacam12Q3UKP4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ceacam12Q3UKP4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ceacam12Q3UKP4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ceacam12Q3UKP4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ceacam12Q3UKP4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ceacam12Q3UKP4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ceacam12Q3UKP4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ceacam12Q3UKP4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ceacam12Q3UKP4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ceacam12Q3UKP4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Ceacam12Q3UKP4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ceacam12Q3UKP4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ceacam12Q3UKP4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ceacam12Q3UKP4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ceacam12Q3UKP4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ceacam12Q3UKP4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ceacam12Q3UKP4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ceacam12Q3UKP4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ceacam12Q3UKP4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ceacam12Q3UKP4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ceacam12Q3UKP4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ceacam12Q3UKP4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ceacam12Q3UKP4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ceacam12Q3UKP4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ceacam12Q3UKP4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ceacam12Q3UKP4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ceacam12Q3UKP4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ceacam12Q3UKP4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ceacam12Q3UKP4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ceacam12Q3UKP4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ceacam12Q3UKP4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ceacam12Q3UKP4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ceacam12Q3UKP4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ceacam12Q3UKP4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ceacam12Q3UKP4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ceacam12Q3UKP4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ceacam12Q3UKP4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ceacam12Q3UKP4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ceacam12Q3UKP4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ceacam12Q3UKP4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ceacam12Q3UKP4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ceacam12Q3UKP4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ceacam12Q3UKP4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ceacam12Q3UKP4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ceacam12Q3UKP4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ceacam12Q3UKP4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ceacam12Q3UKP4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ceacam12Q3UKP4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ceacam12Q3UKP4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ceacam12Q3UKP4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ceacam12Q3UKP4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ceacam12Q3UKP4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ceacam12Q3UKP4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ceacam12Q3UKP4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ceacam12Q3UKP4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ceacam12Q3UKP4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ceacam12Q3UKP4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ceacam12Q3UKP4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ceacam12Q3UKP4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ceacam12Q3UKP4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ceacam12Q3UKP4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ceacam12Q3UKP4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ceacam12Q3UKP4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms