Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Greb1Q3UHK3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Greb1Q3UHK3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Greb1Q3UHK3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Greb1Q3UHK3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Greb1Q3UHK3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Greb1Q3UHK3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Greb1Q3UHK3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Greb1Q3UHK3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Greb1Q3UHK3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Greb1Q3UHK3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Greb1Q3UHK3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Greb1Q3UHK3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Greb1Q3UHK3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Greb1Q3UHK3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Greb1Q3UHK3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Greb1Q3UHK3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Greb1Q3UHK3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Greb1Q3UHK3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Greb1Q3UHK3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Greb1Q3UHK3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Greb1Q3UHK3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Greb1Q3UHK3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Greb1Q3UHK3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Greb1Q3UHK3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Greb1Q3UHK3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Greb1Q3UHK3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Greb1Q3UHK3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Greb1Q3UHK3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Greb1Q3UHK3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Greb1Q3UHK3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Greb1Q3UHK3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Greb1Q3UHK3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Greb1Q3UHK3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Greb1Q3UHK3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Greb1Q3UHK3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Greb1Q3UHK3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Greb1Q3UHK3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Greb1Q3UHK3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Greb1Q3UHK3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Greb1Q3UHK3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Greb1Q3UHK3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Greb1Q3UHK3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Greb1Q3UHK3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Greb1Q3UHK3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Greb1Q3UHK3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Greb1Q3UHK3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Greb1Q3UHK3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Greb1Q3UHK3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Greb1Q3UHK3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Greb1Q3UHK3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Greb1Q3UHK3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Greb1Q3UHK3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Greb1Q3UHK3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Greb1Q3UHK3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Greb1Q3UHK3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Greb1Q3UHK3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Greb1Q3UHK3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Greb1Q3UHK3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Greb1Q3UHK3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Greb1Q3UHK3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Greb1Q3UHK3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Greb1Q3UHK3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Greb1Q3UHK3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Greb1Q3UHK3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Greb1Q3UHK3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Greb1Q3UHK3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Greb1Q3UHK3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Greb1Q3UHK3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Greb1Q3UHK3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Greb1Q3UHK3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Greb1Q3UHK3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Greb1Q3UHK3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Greb1Q3UHK3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Greb1Q3UHK3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Greb1Q3UHK3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Greb1Q3UHK3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Greb1Q3UHK3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Greb1Q3UHK3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Greb1Q3UHK3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Greb1Q3UHK3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Greb1Q3UHK3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Greb1Q3UHK3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Greb1Q3UHK3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Greb1Q3UHK3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Greb1Q3UHK3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Greb1Q3UHK3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Greb1Q3UHK3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Greb1Q3UHK3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Greb1Q3UHK3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Greb1Q3UHK3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Greb1Q3UHK3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Greb1Q3UHK3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Greb1Q3UHK3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Greb1Q3UHK3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Greb1Q3UHK3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Greb1Q3UHK3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Greb1Q3UHK3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Greb1Q3UHK3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Greb1Q3UHK3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms